More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2347 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2347  OmpA/MotB  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1128  OmpA/MotB domain protein  58.38 
 
 
212 aa  218  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0996  OmpA/MotB  58.73 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00954644  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0304  OmpA/MotB domain-containing protein  53.65 
 
 
212 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  56.82 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  56.82 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.13 
 
 
169 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.41 
 
 
172 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.42 
 
 
319 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  34.76 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  38.89 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  34.76 
 
 
165 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3509  OmpA/MotB  33.54 
 
 
164 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140214  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.52 
 
 
170 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  34.76 
 
 
166 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.57 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.78 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 
230 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  44.12 
 
 
174 aa  79  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  36.44 
 
 
230 aa  79  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  40.18 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  32.7 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.84 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.19 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.53 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.61 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.2 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.18 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  38.18 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.61 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  35.96 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.24 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  39.42 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  35.96 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.45 
 
 
175 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.6 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0687  OmpA domain-containing protein  35.5 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182199  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2364  OmpA/MotB  35.09 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.550372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.72 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  39.81 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0363  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.658698  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3199  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.36 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.28 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  40.38 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0563  OmpA domain-containing protein  37.17 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570179  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0668  OmpA/MotB family protein  37.17 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2321  OmpA domain-containing protein  37.17 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149229  normal  0.659387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40.4 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  41.57 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  36.89 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1210  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.25 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240268  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0857  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.26 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000523751  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  33.59 
 
 
1793 aa  72  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.5 
 
 
164 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1112  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.01 
 
 
175 aa  72  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.248876  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2499  hypothetical protein  39.09 
 
 
240 aa  72  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
537 aa  71.6  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2747  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.62 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 
729 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  38 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  44.33 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  43.68 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  38 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.85 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2530  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000768197  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  33.61 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 
498 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1747  OmpA domain-containing protein  34.4 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000284949  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  38 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.19 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  41 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3170  OmpA/MotB  38.6 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1608  OmpA domain-containing protein  37.62 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000267608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1743  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.4 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000604821  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.86 
 
 
673 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2367  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000270429  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2439  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  normal  0.228998 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  32.71 
 
 
626 aa  70.1  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1786  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.4 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000724127  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  43.88 
 
 
459 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  36.27 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.19 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  34.31 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0318  OmpA/MotB domain-containing protein  30.51 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0137068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  37.5 
 
 
734 aa  69.7  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  37.74 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>