More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2499 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2499  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  480  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 
264 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.71 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0304  OmpA/MotB domain-containing protein  39.84 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  46.73 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  41.9 
 
 
367 aa  72.4  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2347  OmpA/MotB  39.09 
 
 
207 aa  72  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0996  OmpA/MotB  45 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00954644  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.82 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  36.61 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0615  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  32.24 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0124381  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  37.17 
 
 
334 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.61 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  34.51 
 
 
363 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  46.67 
 
 
560 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.71 
 
 
321 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  39.81 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  39.81 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  41.67 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  38.1 
 
 
168 aa  63.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 
331 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  38.1 
 
 
168 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  32.14 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  34.78 
 
 
320 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  35.92 
 
 
319 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.77 
 
 
163 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.74 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  40.91 
 
 
358 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  38.52 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 
263 aa  62.8  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0065  OmpA/MotB  38.53 
 
 
617 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.656472  normal  0.842902 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  39.82 
 
 
276 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1474  OmpA/MotB domain-containing protein  41.25 
 
 
163 aa  62.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 
204 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1128  OmpA/MotB domain protein  32.84 
 
 
212 aa  62.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 
356 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 
333 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 
207 aa  62.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  41.07 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.24 
 
 
163 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  39.24 
 
 
163 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  39.24 
 
 
163 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.14 
 
 
168 aa  62  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 
222 aa  62  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 
231 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  31.53 
 
 
660 aa  61.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  40.95 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  37.62 
 
 
466 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1397  OmpA/MotB  36.36 
 
 
176 aa  61.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
166 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  36.61 
 
 
358 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  36.36 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0585  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 
701 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610361  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  36.36 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  34.95 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  34.95 
 
 
319 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  37.96 
 
 
220 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  39.05 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1933  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.61 
 
 
701 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.97 
 
 
163 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  37.96 
 
 
220 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  34.04 
 
 
352 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0462  OmpA family protein  28.76 
 
 
175 aa  60.5  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  37.96 
 
 
220 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  37.96 
 
 
220 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  35.09 
 
 
377 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.21 
 
 
168 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  46.05 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  37.96 
 
 
220 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  46.05 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 
723 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0784  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 
163 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0131111  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.38 
 
 
350 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  35.71 
 
 
350 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 
296 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>