More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5047 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  93.21 
 
 
220 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  84.38 
 
 
224 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  79.82 
 
 
224 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  79.09 
 
 
220 aa  288  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  64 
 
 
228 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  59.55 
 
 
220 aa  246  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  59.55 
 
 
220 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  59.55 
 
 
220 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  58.64 
 
 
220 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  58.18 
 
 
220 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  57.27 
 
 
239 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  49.35 
 
 
248 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
243 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  38.22 
 
 
231 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.51 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  40.55 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  36.55 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  35.02 
 
 
267 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  39.07 
 
 
223 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  38.57 
 
 
236 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 
242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  38.1 
 
 
236 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  38.39 
 
 
236 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  38.39 
 
 
236 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  38.39 
 
 
236 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  38.1 
 
 
236 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  47.86 
 
 
207 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2394  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 
242 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  46.46 
 
 
239 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  52.17 
 
 
227 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  46.28 
 
 
240 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  50.47 
 
 
264 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  47.75 
 
 
219 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 
210 aa  101  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  43.9 
 
 
231 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  42.52 
 
 
237 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  48.6 
 
 
239 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  42.73 
 
 
214 aa  98.6  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 
219 aa  98.2  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  42.73 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  48.65 
 
 
217 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 
187 aa  95.9  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  39.1 
 
 
367 aa  95.1  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  46.96 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  47.57 
 
 
330 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  42.06 
 
 
237 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  43.24 
 
 
294 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  44.04 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  42.06 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  43.24 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.79 
 
 
294 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  36.96 
 
 
188 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  45.71 
 
 
334 aa  92  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 
243 aa  91.7  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.97 
 
 
607 aa  91.7  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  41.44 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 
324 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  46.6 
 
 
326 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  47.66 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  39.81 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  44.19 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.04 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  45.05 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  45.05 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 
296 aa  89.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  43.24 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 
228 aa  88.6  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 
218 aa  88.2  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  41.28 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  39.81 
 
 
229 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  40 
 
 
353 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  41.74 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  40 
 
 
357 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  43.64 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  47.32 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  44.04 
 
 
230 aa  87  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
288 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  44.55 
 
 
321 aa  87  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  40 
 
 
353 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 
216 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 
459 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>