More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1908 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  99.53 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0304  OmpA/MotB domain-containing protein  86.08 
 
 		 212 aa  346  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1128  OmpA/MotB domain protein  53.37 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2347  OmpA/MotB  57.3 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0996  OmpA/MotB  48.73 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00954644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.66 
 
 		 174 aa  92.8  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.2 
 
 		 170 aa  92  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.98 
 
 		 168 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  35.37 
 
 		 168 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.8 
 
 		 170 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0687  OmpA domain-containing protein  44.83 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182199  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.8 
 
 		 170 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  35.37 
 
 		 168 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.1 
 
 		 172 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.34 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  34.81 
 
 		 149 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 362 aa  86.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.43 
 
 		 319 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009720  Xaut_3080  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.86 
 
 		 164 aa  85.9  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430069  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  34.81 
 
 		 165 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  43.27 
 
 		 375 aa  85.5  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.97 
 
 		 172 aa  85.9  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3509  OmpA/MotB  35.33 
 
 		 164 aa  85.5  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140214  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 375 aa  85.5  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  34.81 
 
 		 165 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.1 
 
 		 169 aa  85.5  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  43.64 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  34.18 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2714  OmpA/MotB  39.29 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.6 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.5 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  44.86 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  40.37 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40.37 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  40.37 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  40.37 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39.62 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.57 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  46.59 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.22 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  39.45 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.97 
 
 		 427 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  33.64 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  39.06 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.05 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3199  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.53 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  39.39 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40.95 
 
 		 350 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  38.83 
 
 		 337 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.39 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40.95 
 
 		 350 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.45 
 
 		 344 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  39.06 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0363  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 167 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.658698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  42.2 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  39.06 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.53 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  38.83 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1210  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.76 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  36.7 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.9 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.74 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  42.86 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1803  OmpA/MotB domain protein  36.3 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0668  OmpA/MotB family protein  39.5 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2321  OmpA domain-containing protein  39.5 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149229  normal  0.659387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2499  hypothetical protein  38.71 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2364  OmpA/MotB  32.12 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.550372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.41 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  40.19 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.65 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0563  OmpA domain-containing protein  40 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  41.84 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  41 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  41.18 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.05 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3170  OmpA/MotB  39.66 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190216  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1463  OmpA/MotB domain-containing protein  32.68 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000146392  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2415  OmpA/MotB domain-containing protein  41.49 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  38 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  48 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  38.24 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  35.94 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  34.03 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  45.45 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  39.22 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  38.32 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.02 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  50 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  50 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>