More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0304 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0304  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
212 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  86.08 
 
 
213 aa  345  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  85.57 
 
 
213 aa  344  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1128  OmpA/MotB domain protein  52.04 
 
 
212 aa  205  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2347  OmpA/MotB  53.65 
 
 
207 aa  201  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0996  OmpA/MotB  48.98 
 
 
217 aa  170  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00954644  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0687  OmpA domain-containing protein  43.48 
 
 
173 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182199  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.25 
 
 
170 aa  89  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.72 
 
 
319 aa  88.2  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  44.23 
 
 
375 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 
375 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.52 
 
 
170 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.52 
 
 
170 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.71 
 
 
174 aa  85.9  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.38 
 
 
170 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  37.32 
 
 
168 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  37.32 
 
 
168 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.66 
 
 
181 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.38 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.5 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3509  OmpA/MotB  33.94 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 
362 aa  82  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1395  OmpA/MotB  32.1 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000229219  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.18 
 
 
172 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.17 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2714  OmpA/MotB  39.29 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.05 
 
 
498 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2085  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.81 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000014342  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  38.39 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.79 
 
 
169 aa  79  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  32.35 
 
 
166 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  30.56 
 
 
185 aa  79  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  37.29 
 
 
165 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  42.06 
 
 
170 aa  79  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1463  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 
178 aa  79  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000146392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  42.2 
 
 
327 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.23 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  38.14 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  38.79 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  38.79 
 
 
243 aa  78.2  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  38.38 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  41.82 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  41.44 
 
 
161 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 
623 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.68 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  39.45 
 
 
351 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3080  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.5 
 
 
164 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430069  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  41.07 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  40.37 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40.37 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  40.37 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  32.73 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  38.33 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  43.18 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2747  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.46 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.67 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.54 
 
 
344 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  43.43 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2499  hypothetical protein  39.84 
 
 
240 aa  74.7  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.74 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  46 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1743  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.86 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000604821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1786  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.86 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000724127  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.8 
 
 
177 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1747  OmpA domain-containing protein  30.86 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000284949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.41 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.5 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2367  OmpA/MotB domain-containing protein  30.86 
 
 
178 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000270429  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2439  OmpA/MotB domain-containing protein  30.86 
 
 
178 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  normal  0.228998 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  29.89 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2530  OmpA/MotB domain-containing protein  30.86 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000768197  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  46.46 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  36.81 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  32.92 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.61 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2537  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.29 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000399266  hitchhiker  0.000124284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  47.67 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0563  OmpA domain-containing protein  37.82 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570179  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.05 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.61 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  47.67 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  40.82 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.79 
 
 
429 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  36.43 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.76 
 
 
427 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.13 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  34.76 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3482  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.784899  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1112  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.33 
 
 
175 aa  72  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.248876  normal  0.324066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>