More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1128 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1128  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2347  OmpA/MotB  58.38 
 
 		 207 aa  218  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  54.5 
 
 		 213 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  54.5 
 
 		 213 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0304  OmpA/MotB domain-containing protein  53.67 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0996  OmpA/MotB  53.12 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00954644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  34.55 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.37 
 
 		 170 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  35.03 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.37 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  43.14 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.14 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  37.27 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  36.36 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  33.54 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.21 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0318  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0137068 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0687  OmpA domain-containing protein  41.38 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182199  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  33.13 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  38.38 
 
 		 537 aa  75.5  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 375 aa  75.1  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  38.46 
 
 		 375 aa  75.5  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.14 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.14 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3080  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.39 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430069  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 434 aa  72  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 440 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 		 487 aa  71.6  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1463  OmpA/MotB domain-containing protein  32.14 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000146392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  37.5 
 
 		 149 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.93 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.5 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.93 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  41.58 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.37 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.39 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.59 
 
 		 673 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2563  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.63 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637753  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2747  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.62 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  40.4 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  41.58 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  30.49 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1395  OmpA/MotB  33.54 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000229219  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2364  OmpA/MotB  34.21 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.550372 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2530  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000768197  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  39 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  38.38 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  39 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2367  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000270429  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2439  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  normal  0.228998 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 432 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.78 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0668  OmpA/MotB family protein  36.28 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2321  OmpA domain-containing protein  36.28 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149229  normal  0.659387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0563  OmpA domain-containing protein  35.4 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  39.39 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0728  OmpA domain-containing protein  34.86 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0826309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  30.28 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  31.01 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.41 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.05 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.62 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  35.35 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 277 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  35.78 
 
 		 320 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  40.18 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  40.18 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.1 
 
 		 351 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0363  OmpA/MotB domain-containing protein  33.1 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.658698  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3199  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.73 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  37.93 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  35.92 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.97 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.97 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  34.78 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  33.88 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.71 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  28.02 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  40.18 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1528  OmpA domain-containing protein  35.64 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000113524  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.81 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1608  OmpA domain-containing protein  36.63 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000267608  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  33.65 
 
 		 734 aa  65.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  33.33 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  36.89 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  39.05 
 
 		 350 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>