More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2051 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  568  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  32.87 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 		 409 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  48.04 
 
 		 401 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  42.45 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  41.75 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 357 aa  72  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1234  OmpA/MotB domain-containing protein  36.64 
 
 		 196 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455837  normal  0.175097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  33.57 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2499  hypothetical protein  41.9 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  43.9 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1128  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 		 212 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  46.34 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  39.8 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.78 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  45.12 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  32.28 
 
 		 630 aa  62.4  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 613 aa  62.4  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0562  peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 		 127 aa  62  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  39.33 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  39.33 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  39.33 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0466  OmpA/MotB domain-containing protein  37.59 
 
 		 203 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  35.58 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02683  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000140818  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  40.4 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  33.66 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  40.74 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.09 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03342  hypothetical protein  37 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  39.64 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  34.62 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  43.02 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  34.62 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  34.62 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  34.62 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.47 
 
 		 658 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  34.62 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  34.62 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  34.62 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  34.62 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1012  OmpA domain-containing protein  38.78 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  33.59 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  34.69 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.29 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  39.29 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40.51 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  43.94 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  40.51 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  40.51 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05164  hypothetical protein  31.3 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3719  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.1 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  36.27 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0304  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  35.25 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.81 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 		 169 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  37.11 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 		 169 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.26 
 
 		 173 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  43.75 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1280  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.63 
 
 		 171 aa  57  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000137851  hitchhiker  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  37.65 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.71 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0521  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  37.65 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1908  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.16 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  35.35 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  36.71 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 355 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  37 
 
 		 170 aa  57  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0556  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.63 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  34.65 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3118  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.71 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.396871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  40.3 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  36.36 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 643 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.48 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  35.92 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  37.86 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  34.48 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0108  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  36 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0148  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  36 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125516  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.31 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.24 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  35.96 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>