More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0318 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0318  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  359  1e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0137068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  49.53 
 
 
296 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  48.48 
 
 
294 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 
637 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 
1026 aa  89.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 
223 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  36.84 
 
 
656 aa  89  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 
263 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 
263 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 
262 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 
263 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.68 
 
 
319 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.16 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  41 
 
 
218 aa  84.7  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 
316 aa  84.3  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  38.39 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  41.35 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  41.35 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 
449 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 
506 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2867  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.12 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.859200000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  41 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2955  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.12 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000883314  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  36.3 
 
 
1793 aa  81.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  36.72 
 
 
415 aa  81.3  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  39.13 
 
 
320 aa  81.3  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1398  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.12 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000375397  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  37.5 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  37.5 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 
623 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  37.5 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  37.5 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  37.5 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  37.5 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  31.03 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.42 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  37.5 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  38.83 
 
 
264 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.92 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.92 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 
525 aa  78.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  40 
 
 
333 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.29 
 
 
320 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 
388 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  36.61 
 
 
311 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 
316 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  39.05 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
344 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
316 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.78 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  37.96 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  40 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  35.29 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 
537 aa  77.8  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  36.21 
 
 
510 aa  77.8  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  37.86 
 
 
260 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1220  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  30.2 
 
 
533 aa  77.4  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  38.38 
 
 
228 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  35.09 
 
 
222 aa  77.4  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  39 
 
 
225 aa  77.4  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.02 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  37.86 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  36.13 
 
 
337 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 
498 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1803  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 
537 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2563  peptidoglycan-associated lipoprotein  26.37 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637753  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  33.33 
 
 
669 aa  77.4  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  30.56 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  29.53 
 
 
533 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  40.4 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1128  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  35.58 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  33.33 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.1 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.85 
 
 
407 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  36.36 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.73 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.86 
 
 
707 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  30.17 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 
376 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
1755 aa  75.1  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  29.17 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0728  OmpA domain-containing protein  37.07 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0826309  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  36.63 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  35.71 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  37.27 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 
459 aa  75.1  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>