More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3262 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  100 
 
 		 201 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  65.67 
 
 		 201 aa  290  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  63.68 
 
 		 201 aa  287  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  62.19 
 
 		 201 aa  279  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  62.19 
 
 		 201 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  66.13 
 
 		 201 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  60.61 
 
 		 201 aa  260  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  58.42 
 
 		 202 aa  254  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  57.58 
 
 		 202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  57.92 
 
 		 202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  59.09 
 
 		 202 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  59.09 
 
 		 202 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  59.09 
 
 		 202 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  59.09 
 
 		 202 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  55.5 
 
 		 200 aa  245  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  61.08 
 
 		 185 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  38 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  38.38 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  36.84 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  36.82 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  39.16 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  38.92 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  37.37 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  41.22 
 
 		 367 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  43.84 
 
 		 344 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  43.84 
 
 		 344 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  43.84 
 
 		 344 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  42.76 
 
 		 344 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  43.15 
 
 		 345 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  41.83 
 
 		 403 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  41.22 
 
 		 377 aa  118  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  36.77 
 
 		 365 aa  118  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  41.18 
 
 		 394 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  42.76 
 
 		 401 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  39.19 
 
 		 373 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 367 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  39.74 
 
 		 368 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.91 
 
 		 344 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 392 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  39.46 
 
 		 352 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  37.67 
 
 		 368 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  36.55 
 
 		 381 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 372 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  40.26 
 
 		 344 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40.69 
 
 		 350 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  40.26 
 
 		 366 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40.69 
 
 		 350 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  36.81 
 
 		 372 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.81 
 
 		 373 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 376 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  38.96 
 
 		 345 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  36.11 
 
 		 370 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.06 
 
 		 351 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.31 
 
 		 447 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  36.13 
 
 		 380 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  48.62 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39.31 
 
 		 429 aa  104  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  35.42 
 
 		 366 aa  104  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  34.25 
 
 		 369 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  34.25 
 
 		 369 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 		 417 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 		 369 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 376 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  31.61 
 
 		 367 aa  101  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35.86 
 
 		 333 aa  100  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  44.86 
 
 		 314 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  34.03 
 
 		 363 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  44.34 
 
 		 457 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  37.76 
 
 		 337 aa  99.4  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.51 
 
 		 375 aa  96.7  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 468 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 466 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  36.36 
 
 		 337 aa  95.9  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  44.95 
 
 		 327 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  45.28 
 
 		 466 aa  95.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.57 
 
 		 427 aa  95.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 459 aa  92  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 459 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 454 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 333 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 333 aa  89.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.88 
 
 		 319 aa  88.6  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.21 
 
 		 420 aa  88.2  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 		 296 aa  88.2  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.97 
 
 		 335 aa  87.4  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  35.37 
 
 		 510 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  29.56 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  33.61 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  31.69 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4204  outer membrane protein  29.69 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.255099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  33.99 
 
 		 623 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  39.8 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  39.29 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  29.76 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  38.66 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>