More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01404 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 401 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  36.11 
 
 		 380 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  32.34 
 
 		 417 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  32.65 
 
 		 447 aa  104  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  32.04 
 
 		 429 aa  101  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  37.34 
 
 		 345 aa  101  8e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  37.65 
 
 		 403 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  34.18 
 
 		 201 aa  98.6  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 369 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 369 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  33.85 
 
 		 319 aa  95.9  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  33.95 
 
 		 365 aa  95.9  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  34.18 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  36.71 
 
 		 367 aa  95.5  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  34.18 
 
 		 202 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  34.18 
 
 		 185 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  34.81 
 
 		 202 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  34.81 
 
 		 202 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  33.54 
 
 		 344 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  36.48 
 
 		 394 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  36.25 
 
 		 367 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 359 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  34.81 
 
 		 202 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  36.08 
 
 		 352 aa  93.2  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  36.71 
 
 		 367 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  37.34 
 
 		 370 aa  93.2  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  32.91 
 
 		 344 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  36.48 
 
 		 392 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  40.6 
 
 		 712 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  37.97 
 
 		 372 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.34 
 
 		 373 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  37.34 
 
 		 372 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.39 
 
 		 335 aa  92.8  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  37.98 
 
 		 466 aa  92.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  36.48 
 
 		 376 aa  92.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  32.91 
 
 		 337 aa  92.4  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  32.91 
 
 		 337 aa  92.4  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.23 
 
 		 294 aa  92.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  32.28 
 
 		 344 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  34.32 
 
 		 445 aa  92  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  31.79 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  32.91 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  32.28 
 
 		 344 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.91 
 
 		 427 aa  90.9  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  31.43 
 
 		 381 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  32.28 
 
 		 344 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  34.18 
 
 		 368 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  35.98 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  31.65 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  37.34 
 
 		 377 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  32.28 
 
 		 344 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 333 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  37.34 
 
 		 366 aa  89.4  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  32.62 
 
 		 368 aa  89.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.28 
 
 		 345 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  36.71 
 
 		 376 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  33.12 
 
 		 428 aa  88.6  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 333 aa  88.2  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  36.71 
 
 		 363 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 375 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.53 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.71 
 
 		 369 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 434 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  33.12 
 
 		 264 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  33.54 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  32.28 
 
 		 350 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  33.54 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  32.28 
 
 		 350 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  29.56 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 432 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  31.01 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  37.18 
 
 		 348 aa  85.9  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  32.72 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  31.65 
 
 		 333 aa  85.1  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  31.65 
 
 		 351 aa  85.1  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  36.77 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  36.77 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  31.01 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  33.33 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  30.05 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  33.86 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  32.28 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  30.77 
 
 		 420 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 		 440 aa  82.4  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  29.8 
 
 		 456 aa  82  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  36.42 
 
 		 637 aa  81.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  34.81 
 
 		 373 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  30.38 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  32.48 
 
 		 239 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  29.38 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  32.19 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  37.96 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 623 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  32.28 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  34.11 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.31 
 
 		 542 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  32.18 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>