More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2080 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  100 
 
 		 366 aa  759    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  47.57 
 
 		 368 aa  341  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  34.17 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  31.96 
 
 		 367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  38.93 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  30.13 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  30.13 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  29.87 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.91 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  28 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.08 
 
 		 427 aa  146  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  31.38 
 
 		 344 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  35.46 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  29.33 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  30.67 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40 
 
 		 447 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  26.98 
 
 		 401 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  29.29 
 
 		 350 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  29.29 
 
 		 350 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.98 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  42.53 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  45.51 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  44.87 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  28.65 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  37.89 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  29.19 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 367 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  27.16 
 
 		 403 aa  119  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  34.57 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  39.73 
 
 		 205 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  37.67 
 
 		 208 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 367 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  40.41 
 
 		 204 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  41.03 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  37.67 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  42.31 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  40.26 
 
 		 201 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  40.13 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.43 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  40.13 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 369 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 366 aa  110  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 372 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  36.99 
 
 		 201 aa  109  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  35.86 
 
 		 204 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  35.17 
 
 		 212 aa  106  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  36.87 
 
 		 478 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  33.17 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  36.32 
 
 		 637 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  36.99 
 
 		 201 aa  99.8  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.07 
 
 		 320 aa  99.8  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  32 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 		 202 aa  97.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  36.99 
 
 		 201 aa  97.1  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.36 
 
 		 542 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 200 aa  96.7  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  26.91 
 
 		 335 aa  96.3  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  35.36 
 
 		 543 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 		 201 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  35.36 
 
 		 544 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  36.88 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  35.2 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 		 202 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 		 185 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 		 202 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  35.62 
 
 		 201 aa  94  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 		 466 aa  92.8  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 		 468 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  35.62 
 
 		 202 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  35.62 
 
 		 202 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  32.4 
 
 		 314 aa  92  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 209 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  28.94 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  36.3 
 
 		 202 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 		 202 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  32.96 
 
 		 456 aa  89.7  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  31.64 
 
 		 322 aa  90.1  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  34.93 
 
 		 201 aa  89.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  26.48 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  29.67 
 
 		 240 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 210 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  44.14 
 
 		 457 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  35.37 
 
 		 337 aa  87.8  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 		 459 aa  86.7  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  30.85 
 
 		 374 aa  86.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  35.54 
 
 		 376 aa  86.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  34.93 
 
 		 201 aa  86.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  31.72 
 
 		 623 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  38.94 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  31.72 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  39.81 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1987 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>