More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0958 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  100 
 
 		 352 aa  715    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  33.52 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  34.62 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  38.65 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  33.24 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  34.7 
 
 		 344 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  34.58 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  34.58 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.39 
 
 		 345 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.07 
 
 		 344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  42.94 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  35.12 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.58 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  37.39 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  37.39 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  39.64 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  37.39 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  39.64 
 
 		 394 aa  143  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  40 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.34 
 
 		 447 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.5 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  41.03 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 367 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  41.03 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  40.13 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  39.74 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  43.15 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  36.71 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  39.1 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  38.85 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.65 
 
 		 427 aa  122  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  39.46 
 
 		 201 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 369 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  40.82 
 
 		 208 aa  119  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  37.18 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  38.93 
 
 		 209 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  38.31 
 
 		 201 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  36.05 
 
 		 204 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 200 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  40.74 
 
 		 205 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  46.02 
 
 		 210 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  36.73 
 
 		 204 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  38.36 
 
 		 204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  28.95 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  37.66 
 
 		 201 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  34.93 
 
 		 428 aa  109  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 		 201 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  34.01 
 
 		 212 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  32.81 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  29.44 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  36.05 
 
 		 202 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  36.05 
 
 		 185 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  36.05 
 
 		 202 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  36.05 
 
 		 202 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  36.05 
 
 		 202 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  39.66 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  36.05 
 
 		 202 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  31.17 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  40.88 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  36.73 
 
 		 201 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  35.56 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  38.94 
 
 		 466 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  34.69 
 
 		 202 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  34.69 
 
 		 202 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 		 201 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  34.87 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  27.14 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  35.06 
 
 		 201 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 466 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  36.08 
 
 		 440 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  29.15 
 
 		 457 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 		 468 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  29.71 
 
 		 445 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  28.93 
 
 		 420 aa  96.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  33.55 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.19 
 
 		 218 aa  93.6  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  39.46 
 
 		 510 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 333 aa  93.2  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 333 aa  92.8  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.44 
 
 		 478 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 449 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  28.33 
 
 		 459 aa  89.7  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.67 
 
 		 543 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  38.36 
 
 		 544 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  34.55 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  33.54 
 
 		 456 aa  87.8  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  29.61 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  37.58 
 
 		 637 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  42.2 
 
 		 443 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.99 
 
 		 542 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>