More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0250 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  100 
 
 		 368 aa  759    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  47.57 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  33.52 
 
 		 352 aa  210  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  35.78 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  33.53 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  30.3 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  32.52 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  28.2 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  30.85 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  30.32 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  30.32 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  30.61 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  29.56 
 
 		 417 aa  142  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  30.45 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  29.37 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  30.03 
 
 		 365 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  27.91 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  28.72 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  30.69 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  45.51 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  37.99 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  43.71 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  43.71 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  26.25 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  41.67 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 376 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  26.67 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  28.83 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  28.83 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  41.61 
 
 		 201 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  41.67 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  28.19 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 366 aa  119  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  40.13 
 
 		 204 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  39.74 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  27.86 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  27.3 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  37.67 
 
 		 201 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  38.16 
 
 		 204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  40.13 
 
 		 368 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  37.09 
 
 		 208 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  36.2 
 
 		 201 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 		 201 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  37.5 
 
 		 212 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  38 
 
 		 205 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 		 202 aa  106  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.1 
 
 		 209 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  34.97 
 
 		 202 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  36.05 
 
 		 202 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  34.97 
 
 		 202 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  36.05 
 
 		 185 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  36.05 
 
 		 202 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  36.42 
 
 		 204 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  36.81 
 
 		 202 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  36.81 
 
 		 202 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 200 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 201 aa  99.4  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 		 201 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  25.59 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.39 
 
 		 294 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  35.37 
 
 		 201 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 		 201 aa  97.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  26.52 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  30.41 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  39.16 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  28.63 
 
 		 345 aa  93.6  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  39.16 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  34.08 
 
 		 314 aa  90.1  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  31.19 
 
 		 376 aa  89.7  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  32.62 
 
 		 218 aa  89.7  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 210 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  29.9 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  25.45 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  36.81 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  36.44 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  30.11 
 
 		 543 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  29.1 
 
 		 623 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  33.51 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.03 
 
 		 542 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  29.69 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  29.03 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  31.18 
 
 		 490 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  48.72 
 
 		 1707 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  34.86 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  33.13 
 
 		 189 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  29.79 
 
 		 637 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  27.91 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  36.19 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1987 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>