More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02380 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  75.37 
 
 		 204 aa  333  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  67.34 
 
 		 204 aa  281  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  72.53 
 
 		 208 aa  278  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  67.22 
 
 		 212 aa  262  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  55.28 
 
 		 205 aa  234  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  54.36 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  41.57 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  38.92 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  34.98 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  35.64 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  37.35 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  38.69 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  38.69 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  37.95 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  37.95 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  36.73 
 
 		 352 aa  111  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  38.16 
 
 		 368 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  32.14 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  38.82 
 
 		 367 aa  111  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  36.9 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  42 
 
 		 376 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  35.93 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  35.86 
 
 		 366 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  39.73 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  39.73 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  38.62 
 
 		 344 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  37.37 
 
 		 403 aa  102  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  34.9 
 
 		 365 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  36.6 
 
 		 367 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  34.83 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  39.04 
 
 		 363 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37.24 
 
 		 401 aa  101  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.85 
 
 		 350 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.85 
 
 		 350 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  39.04 
 
 		 366 aa  101  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  37.84 
 
 		 377 aa  101  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  39.04 
 
 		 369 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.31 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.31 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.42 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.82 
 
 		 345 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.31 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  37.67 
 
 		 370 aa  99.4  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  37.67 
 
 		 372 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.67 
 
 		 373 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  36.36 
 
 		 394 aa  98.6  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  38.51 
 
 		 373 aa  98.2  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  37.67 
 
 		 372 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  37.16 
 
 		 368 aa  98.2  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.44 
 
 		 351 aa  97.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 392 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  34.57 
 
 		 344 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 490 aa  94.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35.95 
 
 		 333 aa  94.7  8e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  28.28 
 
 		 367 aa  91.7  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  34.97 
 
 		 337 aa  90.5  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  33.79 
 
 		 337 aa  89.4  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  31.03 
 
 		 381 aa  89  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.12 
 
 		 447 aa  86.3  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  33.78 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 		 417 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  32.17 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  31.51 
 
 		 380 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  32.26 
 
 		 429 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  32.89 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  29.93 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  30.32 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  28.97 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  39.42 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  36 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  39.42 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  31.76 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  29.68 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  32.37 
 
 		 404 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  32.05 
 
 		 240 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  30.71 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  34.64 
 
 		 637 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  37.27 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  34.95 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  30.22 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  29.8 
 
 		 376 aa  68.6  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  29.68 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 459 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 		 333 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  32.41 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  31.52 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  27.37 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  30.07 
 
 		 374 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>