More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001578 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  100 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  58.13 
 
 		 204 aa  244  9e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  56.28 
 
 		 204 aa  234  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  55.28 
 
 		 204 aa  234  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  58.2 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  54.82 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  52.76 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  39.71 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.16 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  40.12 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  40.12 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  39.73 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  33.84 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  41.5 
 
 		 352 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  40.48 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  37.95 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  38 
 
 		 368 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  37.87 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  37.87 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  38.55 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  38.55 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  40.24 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  39.22 
 
 		 377 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  35.67 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  40.82 
 
 		 366 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  40.14 
 
 		 363 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  40.14 
 
 		 369 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  33.85 
 
 		 403 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  39.87 
 
 		 373 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 		 376 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  38.51 
 
 		 367 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 		 372 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  38.78 
 
 		 369 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  38.78 
 
 		 370 aa  99.4  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  35.86 
 
 		 401 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 		 372 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 		 369 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  38.51 
 
 		 367 aa  99  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 		 373 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  34.48 
 
 		 367 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  37.33 
 
 		 368 aa  96.3  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  34.81 
 
 		 394 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  34.81 
 
 		 392 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  35.17 
 
 		 428 aa  92.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  32.89 
 
 		 365 aa  92  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  34.62 
 
 		 350 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  34.62 
 
 		 350 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  33.96 
 
 		 351 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  30.59 
 
 		 333 aa  87.4  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  33.1 
 
 		 381 aa  85.5  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  32 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  32.67 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  32.67 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  32.67 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  32.67 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.12 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.55 
 
 		 447 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.33 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  30.67 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  30.99 
 
 		 429 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  33.57 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  31.03 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 454 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  31.69 
 
 		 335 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  30.22 
 
 		 345 aa  75.1  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  32.45 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  36.62 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  32.5 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  31.53 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3499  OmpA/MotB  30.73 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  35 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4204  outer membrane protein  33.11 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.255099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  37 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  31.67 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  31.47 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  30.54 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  30.92 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  33.11 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  29.68 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  30.63 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  33.78 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  28.77 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  33.93 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  31.16 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  30.77 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  28.77 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  28.08 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  35.4 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  32.04 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  27.42 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  32.86 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  28.77 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>