More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3595 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  88.44 
 
 		 202 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  89.45 
 
 		 202 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  87 
 
 		 202 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  87 
 
 		 202 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  84.5 
 
 		 202 aa  359  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  84.5 
 
 		 202 aa  359  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  84.42 
 
 		 201 aa  352  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  90.11 
 
 		 185 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  63.32 
 
 		 201 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  60.8 
 
 		 201 aa  259  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  57.29 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  59.8 
 
 		 201 aa  247  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  59.46 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  56.78 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  53.72 
 
 		 201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  36.27 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  39.16 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  35 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  34.34 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  37.42 
 
 		 380 aa  114  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  38.36 
 
 		 344 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  33.84 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  37.58 
 
 		 373 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  36.47 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  39.31 
 
 		 401 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  38.93 
 
 		 377 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.36 
 
 		 350 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  36.9 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.36 
 
 		 350 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  38.78 
 
 		 370 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  40.54 
 
 		 381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.99 
 
 		 344 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.99 
 
 		 344 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 		 373 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  40.14 
 
 		 366 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.99 
 
 		 344 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.99 
 
 		 344 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 		 403 aa  108  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  39.04 
 
 		 351 aa  108  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 		 372 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  37.16 
 
 		 367 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 369 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 369 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  35.62 
 
 		 345 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  38.78 
 
 		 368 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39.31 
 
 		 429 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  36.99 
 
 		 344 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 369 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40 
 
 		 447 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 		 363 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  37.33 
 
 		 376 aa  104  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  36.05 
 
 		 352 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  36.49 
 
 		 367 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  35.9 
 
 		 368 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  37.42 
 
 		 394 aa  102  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  38.51 
 
 		 376 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  37.42 
 
 		 392 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.3 
 
 		 345 aa  99.8  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.51 
 
 		 375 aa  99.4  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  45.19 
 
 		 457 aa  99  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 314 aa  98.2  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  45.19 
 
 		 466 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  36.3 
 
 		 366 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  31.85 
 
 		 365 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  34.93 
 
 		 417 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.93 
 
 		 319 aa  95.9  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.41 
 
 		 427 aa  96.3  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 454 aa  95.1  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  46 
 
 		 466 aa  94.7  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  34.81 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  46 
 
 		 468 aa  94  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  32.87 
 
 		 337 aa  94.4  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  29.55 
 
 		 333 aa  92.8  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  32.87 
 
 		 337 aa  92  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  39.73 
 
 		 510 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  32.88 
 
 		 367 aa  90.5  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  40.37 
 
 		 327 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 		 428 aa  89  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 459 aa  88.2  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 459 aa  88.2  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.21 
 
 		 420 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  32.87 
 
 		 335 aa  86.3  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 333 aa  85.9  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 333 aa  85.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  45.54 
 
 		 218 aa  85.1  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.37 
 
 		 478 aa  84.7  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  36.75 
 
 		 712 aa  83.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  36.7 
 
 		 640 aa  82.4  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  34.51 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  35.1 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 432 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  32.17 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>