More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2436 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  100 
 
 		 320 aa  655    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  46.59 
 
 		 478 aa  224  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  44.8 
 
 		 727 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  44.78 
 
 		 487 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  43.38 
 
 		 456 aa  196  6e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  42.8 
 
 		 440 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  48.34 
 
 		 544 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  47.87 
 
 		 543 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  48.34 
 
 		 542 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  42.97 
 
 		 1755 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  40.88 
 
 		 374 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  47.87 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  39.5 
 
 		 1987 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  39.26 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  40.68 
 
 		 623 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.29 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  44.21 
 
 		 506 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  35.21 
 
 		 386 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.07 
 
 		 447 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  35.07 
 
 		 386 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.21 
 
 		 412 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  40.86 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.69 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  41.85 
 
 		 510 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  44.34 
 
 		 429 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  40.09 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  41.98 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  31.91 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  40.1 
 
 		 1264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  36.91 
 
 		 637 aa  112  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  46.67 
 
 		 1026 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  41.83 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  44.67 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  39.75 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  51.89 
 
 		 215 aa  109  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.14 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  30.11 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  36.81 
 
 		 381 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  43.65 
 
 		 707 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  41.08 
 
 		 498 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  47.22 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  39.51 
 
 		 449 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  33.7 
 
 		 244 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  40.5 
 
 		 525 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 540 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  44.44 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  46.6 
 
 		 193 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  45.54 
 
 		 229 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 239 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  47.12 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.65 
 
 		 445 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.76 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  34.07 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  44.86 
 
 		 670 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  46.85 
 
 		 229 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 209 aa  99.4  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  34.64 
 
 		 237 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  39.16 
 
 		 344 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  47.75 
 
 		 229 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  48.08 
 
 		 230 aa  98.2  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  46.67 
 
 		 505 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  32.54 
 
 		 424 aa  97.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  42.02 
 
 		 630 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  47.12 
 
 		 233 aa  96.3  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.67 
 
 		 537 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40.27 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  45.28 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40.27 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  40.94 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40.94 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  45.19 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  38.93 
 
 		 653 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  40.94 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 		 288 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  44.14 
 
 		 229 aa  94  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  43.75 
 
 		 233 aa  94  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40.98 
 
 		 215 aa  93.6  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  48.51 
 
 		 185 aa  93.2  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40.27 
 
 		 344 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  39.06 
 
 		 673 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  34.08 
 
 		 264 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 360 aa  92.8  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  36.81 
 
 		 345 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  41.27 
 
 		 459 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  39.86 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.93 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  34.08 
 
 		 239 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 		 570 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  41.67 
 
 		 694 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 638 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  47.17 
 
 		 175 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  41.9 
 
 		 620 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  42.2 
 
 		 641 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>