More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0114 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  100 
 
 		 342 aa  697    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  37.42 
 
 		 367 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  37.09 
 
 		 356 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  31.39 
 
 		 355 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  34.27 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  33.99 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  33.89 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  34.67 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  33.99 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  33.61 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  33.99 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  33.7 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  33.71 
 
 		 354 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  33.81 
 
 		 346 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  33.81 
 
 		 346 aa  155  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  33.81 
 
 		 346 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  33.81 
 
 		 346 aa  155  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  33.81 
 
 		 346 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  33.71 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  35.04 
 
 		 358 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  31.29 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  33.91 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  31.04 
 
 		 357 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  31.04 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  31.04 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  30.9 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  36.27 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  31.09 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  34.27 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  31.4 
 
 		 361 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  32.99 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  32.56 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  30.43 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  30.65 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  31.91 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  31.39 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  30.72 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  32.05 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  27.22 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  31.5 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  30.46 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  30.46 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  45.76 
 
 		 218 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  29.43 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  27.75 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  32.71 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  44.63 
 
 		 244 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  50.96 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  25.74 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  25.74 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  28.42 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  28.12 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  42.65 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  27.01 
 
 		 369 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  42.65 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  42.65 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  28.71 
 
 		 468 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 		 239 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  27.01 
 
 		 363 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  27.67 
 
 		 372 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  27.75 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 		 264 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  48.54 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  32.47 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  27.4 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  28.42 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  26.78 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  47.17 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  51.11 
 
 		 429 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  42.61 
 
 		 175 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  25.35 
 
 		 367 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40.44 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  27.7 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  47.12 
 
 		 215 aa  93.2  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  55.95 
 
 		 210 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  40.44 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.18 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  60 
 
 		 230 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  52.33 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 		 205 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  39.86 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  53.76 
 
 		 230 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  55.95 
 
 		 447 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  53.76 
 
 		 230 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  26.93 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  49.51 
 
 		 239 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  53.76 
 
 		 230 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.57 
 
 		 237 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  48.54 
 
 		 229 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  54.32 
 
 		 209 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  28.01 
 
 		 466 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  56.79 
 
 		 294 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 223 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  51.19 
 
 		 466 aa  89.7  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  46.6 
 
 		 260 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  40.46 
 
 		 229 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  56.63 
 
 		 230 aa  89.4  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  46.94 
 
 		 537 aa  89.4  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  54.32 
 
 		 209 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>