More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1819 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  100 
 
 		 367 aa  756    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  37.42 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  35.45 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  33.06 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  35.37 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  34.87 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  33.14 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  31.83 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  31.83 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  31.75 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  31.83 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  31.83 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  31.75 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  31.83 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  34.67 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  32.48 
 
 		 358 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  30.56 
 
 		 357 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  30.56 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  30.56 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  32.19 
 
 		 369 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  32.3 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  31.91 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  31.91 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  32.38 
 
 		 321 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  31.91 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  32.29 
 
 		 351 aa  166  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  32.27 
 
 		 321 aa  166  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  31.16 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  30.4 
 
 		 361 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  30.21 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  31.32 
 
 		 358 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  29.89 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  30.25 
 
 		 366 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  32.62 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  30.48 
 
 		 320 aa  143  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  30.87 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  29.89 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  27.38 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  27.53 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  46.77 
 
 		 240 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  30.26 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  45.08 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  44.83 
 
 		 244 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  27.05 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  41.94 
 
 		 223 aa  103  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  39.37 
 
 		 239 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  27.76 
 
 		 376 aa  102  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  30.06 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  26.85 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 239 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  28.26 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  30.06 
 
 		 319 aa  99.4  8e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  46.36 
 
 		 209 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  26.54 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  48.08 
 
 		 215 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.67 
 
 		 607 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  49.5 
 
 		 230 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  49.5 
 
 		 230 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  45.54 
 
 		 228 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  50.5 
 
 		 230 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 228 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 219 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  50.5 
 
 		 230 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  24.85 
 
 		 365 aa  96.7  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  51.06 
 
 		 216 aa  96.7  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  51.06 
 
 		 216 aa  96.7  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  47.47 
 
 		 319 aa  96.3  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 		 228 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 209 aa  95.9  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  45.63 
 
 		 219 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  47.01 
 
 		 210 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  29.77 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 209 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  47.01 
 
 		 210 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 200 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.76 
 
 		 220 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 		 218 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  44.55 
 
 		 214 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 		 244 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 218 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 219 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 296 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 242 aa  94  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  45.1 
 
 		 212 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  44.12 
 
 		 294 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  44.76 
 
 		 221 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 209 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 		 221 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 		 221 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  44.55 
 
 		 212 aa  92.8  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  26.4 
 
 		 468 aa  92.8  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  46.81 
 
 		 217 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 215 aa  92  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 224 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.71 
 
 		 230 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  42.02 
 
 		 229 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  42.02 
 
 		 248 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  45.54 
 
 		 231 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>