More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000755 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  100 
 
 		 326 aa  674    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  83.44 
 
 		 321 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  59.42 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  58.79 
 
 		 334 aa  358  8e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  41.52 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  41.21 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  39.58 
 
 		 320 aa  225  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  35.99 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  31.38 
 
 		 367 aa  165  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  31.15 
 
 		 356 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  30.19 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  31.27 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  31.1 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  27.39 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  28.76 
 
 		 324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  28.21 
 
 		 369 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  28.21 
 
 		 369 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  28.74 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  28.37 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  26.99 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  28.85 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  28.45 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  28.65 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  28.65 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  28.65 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  28.65 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  28.65 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  27.35 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  27.35 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  28.85 
 
 		 350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  28.65 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  28.77 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  27.35 
 
 		 357 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  28.08 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  28.11 
 
 		 358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  28.11 
 
 		 369 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  28.19 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  27.81 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  28.05 
 
 		 363 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  27.81 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  28.05 
 
 		 369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  26.74 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  28.24 
 
 		 371 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  28.41 
 
 		 368 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  27.95 
 
 		 370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  26.96 
 
 		 376 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  28.31 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  27.98 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  25.85 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  28.32 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  26.29 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  25.53 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  46.67 
 
 		 230 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  29.7 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  44.14 
 
 		 226 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  25.61 
 
 		 366 aa  96.7  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  24.93 
 
 		 373 aa  95.9  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  42.31 
 
 		 478 aa  94  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  27.58 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  41.12 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  41.12 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  41.12 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  41.12 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 227 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  41.12 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.8 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  28.16 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  30.03 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  40.37 
 
 		 220 aa  90.5  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  26 
 
 		 346 aa  90.1  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  44.86 
 
 		 429 aa  89.7  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  49.37 
 
 		 215 aa  89.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  42.16 
 
 		 456 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  39.05 
 
 		 422 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  44.34 
 
 		 447 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  41.12 
 
 		 220 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  27.04 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  40.78 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 228 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  25.36 
 
 		 454 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  42.72 
 
 		 261 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  42.72 
 
 		 261 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  45.63 
 
 		 415 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  44.55 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  46.75 
 
 		 215 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  34.81 
 
 		 240 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  46.75 
 
 		 215 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  46.75 
 
 		 215 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  46.75 
 
 		 215 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  46.75 
 
 		 215 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  46.75 
 
 		 215 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>