More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2237 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  70.91 
 
 		 210 aa  287  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  66.67 
 
 		 218 aa  280  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  66.67 
 
 		 218 aa  280  8.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  71.17 
 
 		 214 aa  276  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  68.47 
 
 		 219 aa  270  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  67.12 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  67.13 
 
 		 212 aa  262  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  58.37 
 
 		 242 aa  247  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  65.2 
 
 		 217 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  58.59 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  54.92 
 
 		 243 aa  212  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  58.88 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  58.88 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  57.58 
 
 		 218 aa  204  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  54.39 
 
 		 215 aa  204  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  54.39 
 
 		 215 aa  204  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  54.82 
 
 		 215 aa  204  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  54.55 
 
 		 217 aa  203  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  48.83 
 
 		 187 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  51.97 
 
 		 222 aa  195  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  51.97 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  51.97 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  51.97 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  51.97 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  51.97 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  51.97 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  50.87 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  50.87 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  50.87 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  50.87 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  50.43 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  50.87 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  50 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 		 188 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  51.63 
 
 		 179 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  44.21 
 
 		 232 aa  168  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  54.42 
 
 		 607 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  47.79 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  47.56 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  42.11 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  45.16 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  51.56 
 
 		 609 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  45.86 
 
 		 363 aa  121  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  43.72 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.58 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  55.66 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  50.98 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  45.08 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 264 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  45.24 
 
 		 387 aa  104  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  43.15 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  37.18 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  45.97 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  46.36 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  49.02 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  47.97 
 
 		 352 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  50.98 
 
 		 294 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  47.79 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  47.79 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  47.79 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  50.49 
 
 		 266 aa  101  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  42.95 
 
 		 345 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  40.4 
 
 		 468 aa  101  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  46.36 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  48.7 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  50.46 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  52.29 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  44.55 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  44.12 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.84 
 
 		 345 aa  99  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  46.85 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 243 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  48.04 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  45.95 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  47.37 
 
 		 344 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  45.05 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  47.37 
 
 		 344 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  47.37 
 
 		 344 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  48.11 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  45.05 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  45.95 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  48.11 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  48.11 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  48.25 
 
 		 344 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  35.4 
 
 		 367 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  47.17 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  43.64 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  45.05 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  48.54 
 
 		 407 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  42.04 
 
 		 350 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  42.52 
 
 		 358 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  45.37 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  42.52 
 
 		 350 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  42.04 
 
 		 350 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>