More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6618 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  49.35 
 
 		 224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  47.66 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  47.66 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  47.66 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  48.13 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  45.64 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.2 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  46.32 
 
 		 220 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.75 
 
 		 220 aa  194  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  48.33 
 
 		 220 aa  194  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  46.32 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  46.32 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  45.02 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  46.26 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  45.5 
 
 		 242 aa  174  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 		 231 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  40.43 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  39.32 
 
 		 267 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.68 
 
 		 235 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  33.78 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.3 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  34.39 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  32.73 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  32.73 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  32.73 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  32.73 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  32.73 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  44.64 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 219 aa  92.4  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.11 
 
 		 607 aa  92.4  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  39.29 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  38.74 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  39.71 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  42.59 
 
 		 216 aa  88.6  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 216 aa  88.6  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  35.76 
 
 		 367 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  46.3 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2394  OmpA/MotB domain protein  28.45 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.1 
 
 		 609 aa  85.9  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  38.89 
 
 		 225 aa  85.1  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  40.78 
 
 		 223 aa  85.1  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  41.88 
 
 		 648 aa  84.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  42.73 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  46.6 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.82 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  43.52 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  43.12 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  44.12 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  45.05 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  45.13 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  45.05 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  43.12 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  45.05 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  42.99 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  42.99 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  40.91 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  39.67 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  30.74 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  42.2 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  30.74 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  30.74 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  41.59 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  46.23 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1913  OmpA/MotB  47.52 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467087  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  34.92 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 487 aa  79  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  38.53 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>