More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0587 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  74.72 
 
 		 266 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  53.97 
 
 		 243 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  49.17 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  47.98 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  40.83 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  38.4 
 
 		 220 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  38.72 
 
 		 220 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  38.72 
 
 		 220 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.4 
 
 		 220 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  39.57 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  38.72 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  40.68 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  37.13 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  33.78 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  33.78 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  33.78 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  34.98 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  35.32 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.43 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 247 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 240 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  43.24 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  43.24 
 
 		 237 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  42.11 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  41.07 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.71 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  41.07 
 
 		 229 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  45.1 
 
 		 222 aa  89.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  41.28 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2394  OmpA/MotB domain protein  31.12 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  40.18 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  44.76 
 
 		 334 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 207 aa  86.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 210 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.15 
 
 		 321 aa  86.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 242 aa  85.9  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  43.43 
 
 		 228 aa  85.9  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  46.15 
 
 		 217 aa  85.9  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 		 227 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  34.69 
 
 		 236 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  41.22 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  41.22 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  41.22 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 214 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  41.22 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  41.22 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  41.22 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  42.42 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.04 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  41.22 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  41.22 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  40.57 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  31.73 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.88 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  39.64 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  45 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.6 
 
 		 215 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  32.05 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  30.05 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.74 
 
 		 607 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  38.69 
 
 		 445 aa  79.3  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  33.74 
 
 		 468 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  46.3 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 166 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.86 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 218 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  35.09 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  38.16 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  40.78 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  38.1 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>