More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3372 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  74.72 
 
 		 267 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  53.72 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  50.83 
 
 		 234 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  38.3 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.93 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  36.93 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  36.93 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 220 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  36.93 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  39.43 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.11 
 
 		 220 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  35.11 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  35.11 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  35.11 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  34.98 
 
 		 224 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  35.27 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  34.08 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.5 
 
 		 235 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  49.52 
 
 		 334 aa  96.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  41.96 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  41.04 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.76 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  41.23 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 		 222 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  40.54 
 
 		 237 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 240 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 231 aa  89.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 236 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  40.54 
 
 		 237 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  40.18 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  38.1 
 
 		 330 aa  85.9  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  45.45 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  37.6 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.45 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  41.41 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  43.27 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  39.64 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  44.23 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  43.56 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  40.4 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  43 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  40 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.31 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.18 
 
 		 607 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2394  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  43.88 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  38.74 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  40.16 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.53 
 
 		 707 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35.71 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.33 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  40.38 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  33.05 
 
 		 638 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  37.14 
 
 		 509 aa  76.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  29.58 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  38.1 
 
 		 533 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  33.58 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  35.96 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 537 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  31.22 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  36.44 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 239 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 		 175 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  47.22 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  41.58 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  37.59 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>