More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6364 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  46.64 
 
 		 242 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  42.61 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  40.09 
 
 		 239 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.52 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  40.09 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  40.09 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 228 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  40.83 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  40.25 
 
 		 234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  39.15 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  39.15 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  39.15 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.57 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  39.52 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.79 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  36.82 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  37.17 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  36.82 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  36.82 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  36.36 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  36.36 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  36.36 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  49.54 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  46.03 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.92 
 
 		 607 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  49.04 
 
 		 261 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  49.04 
 
 		 261 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  41.94 
 
 		 330 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  44.95 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  44.95 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  44.55 
 
 		 294 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  43.12 
 
 		 266 aa  95.5  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 187 aa  95.5  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.65 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  47.52 
 
 		 463 aa  95.1  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  40.83 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.1 
 
 		 294 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44.55 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.2 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 360 aa  94  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  43.64 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 		 630 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  41.73 
 
 		 356 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2394  OmpA/MotB domain protein  32.47 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  43.94 
 
 		 352 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  37.98 
 
 		 464 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  42.86 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  38.78 
 
 		 468 aa  92.4  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.84 
 
 		 344 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.86 
 
 		 609 aa  92  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  46.53 
 
 		 464 aa  91.7  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  38.41 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  40.3 
 
 		 375 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  39.06 
 
 		 344 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  43.64 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  43.64 
 
 		 316 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  43.64 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  40.3 
 
 		 375 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  43.64 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  46.94 
 
 		 447 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  36.43 
 
 		 464 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  43.64 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  43.64 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  43.64 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  43.28 
 
 		 587 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  43.69 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  43.64 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  43.69 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  48.6 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  38.28 
 
 		 344 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.28 
 
 		 350 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  38.28 
 
 		 344 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.16 
 
 		 542 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.82 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.82 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.28 
 
 		 350 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  43.93 
 
 		 321 aa  89.7  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  38.28 
 
 		 344 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  38.41 
 
 		 466 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>