More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2789 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  85.45 
 
 		 214 aa  341  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  75.23 
 
 		 218 aa  307  9e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  75.23 
 
 		 218 aa  307  9e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  74.43 
 
 		 219 aa  306  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  76.42 
 
 		 212 aa  291  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  71.89 
 
 		 219 aa  285  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  65.02 
 
 		 242 aa  277  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  70.45 
 
 		 219 aa  272  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  72.27 
 
 		 217 aa  262  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  53.39 
 
 		 215 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  61.78 
 
 		 218 aa  217  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  52.94 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  56.07 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  53.4 
 
 		 187 aa  214  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  57.59 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  52.49 
 
 		 215 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  57.59 
 
 		 217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  60 
 
 		 218 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  60 
 
 		 218 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 188 aa  202  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  50.98 
 
 		 209 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  49.33 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  49.33 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  49.33 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  49.33 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  49.33 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  49.55 
 
 		 222 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  49.55 
 
 		 222 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  48.43 
 
 		 224 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  49.55 
 
 		 222 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  49.55 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.55 
 
 		 222 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  49.55 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  49.55 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  51.41 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  53.48 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  53.48 
 
 		 219 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  56.16 
 
 		 607 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  48.7 
 
 		 232 aa  165  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  47.06 
 
 		 609 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  41.95 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  46.85 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  43.37 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  41.27 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  41.57 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  44.8 
 
 		 387 aa  108  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40.79 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 239 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  51.89 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  47.17 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  48.04 
 
 		 231 aa  104  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  43.97 
 
 		 294 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  51.3 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  47.01 
 
 		 344 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  43.97 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  47.01 
 
 		 344 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  47.01 
 
 		 344 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  36.57 
 
 		 345 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 		 222 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 230 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  47.01 
 
 		 344 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  41.32 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  37.95 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  42.48 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  42.48 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  48.04 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  48.18 
 
 		 375 aa  99.8  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  43.64 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  41.73 
 
 		 468 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  43.64 
 
 		 220 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 220 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  42.48 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 		 243 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  35.33 
 
 		 242 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  47.01 
 
 		 350 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 241 aa  98.2  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  44.12 
 
 		 241 aa  98.2  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  47.01 
 
 		 350 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  47.66 
 
 		 294 aa  97.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  38.71 
 
 		 355 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  46.27 
 
 		 344 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  41.86 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  41.86 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  45.63 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.73 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  48.15 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>