More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0712 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  94.5 
 
 		 218 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  85.32 
 
 		 218 aa  345  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  85.32 
 
 		 218 aa  337  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  85.32 
 
 		 218 aa  337  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  65.26 
 
 		 215 aa  263  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  65.26 
 
 		 215 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  67.14 
 
 		 215 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  66.5 
 
 		 209 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  66.51 
 
 		 224 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  66.51 
 
 		 224 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  66.51 
 
 		 224 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  66.51 
 
 		 224 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  66.51 
 
 		 224 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  59.56 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  65.6 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  59.56 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  59.73 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  65.44 
 
 		 222 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  65.44 
 
 		 222 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  64.98 
 
 		 222 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  64.52 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  64.52 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  64.52 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  64.52 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  59.03 
 
 		 219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  53.71 
 
 		 214 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  52.65 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  65.7 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  56.09 
 
 		 212 aa  211  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  58.67 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  54 
 
 		 219 aa  203  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  50.23 
 
 		 187 aa  185  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  47.52 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  48.92 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  48.92 
 
 		 219 aa  174  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  46.95 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  47.53 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  46.19 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.97 
 
 		 607 aa  138  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  50.79 
 
 		 387 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  47.52 
 
 		 609 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  45 
 
 		 363 aa  117  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 		 373 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  43.08 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  43.08 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  43.08 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  43.08 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  43.08 
 
 		 350 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  43.08 
 
 		 358 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  43.08 
 
 		 354 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  43.08 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  43.08 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  42.07 
 
 		 353 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  42.07 
 
 		 357 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  42.07 
 
 		 353 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  43.75 
 
 		 354 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  41.41 
 
 		 355 aa  99.8  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  42.31 
 
 		 351 aa  99.4  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  36.56 
 
 		 227 aa  98.2  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  42.97 
 
 		 361 aa  98.2  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  42.97 
 
 		 366 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  40.77 
 
 		 369 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.27 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2907  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.95 
 
 		 372 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  40 
 
 		 371 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  40 
 
 		 358 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  40 
 
 		 369 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  40 
 
 		 358 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  40.77 
 
 		 358 aa  95.5  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 276 aa  94.7  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  35.12 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  38.19 
 
 		 271 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  35.12 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  38.19 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  35.12 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  35.12 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  35.12 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 244 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6867  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 		 371 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301365  normal  0.329522 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  35.11 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2929  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.35 
 
 		 359 aa  88.2  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 276 aa  88.2  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 		 376 aa  86.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2529  OmpA/MotB domain-containing protein  37.6 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1488  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  32.74 
 
 		 298 aa  85.1  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3525  OmpA/MotB domain-containing protein  45.31 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0237  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2203  ompA family protein  33.94 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.505527  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.86 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2065  ompA family protein  34.55 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  40.8 
 
 		 831 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3148  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  40.8 
 
 		 831 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  37.69 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  37.69 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  37.69 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>