More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6593 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  41.95 
 
 
236 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  41.89 
 
 
223 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  41.53 
 
 
236 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  41.53 
 
 
236 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  41.53 
 
 
236 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  41.1 
 
 
236 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  41.1 
 
 
236 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2394  OmpA/MotB domain protein  42.6 
 
 
240 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  39.91 
 
 
224 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2907  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.44 
 
 
372 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6867  OmpA/MotB domain protein  42.33 
 
 
371 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301365  normal  0.329522 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  38.63 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  39.46 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  38.63 
 
 
220 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  38.63 
 
 
220 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  39.46 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  38.36 
 
 
221 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  38.36 
 
 
221 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  38.36 
 
 
221 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6884  OmpA/MotB domain protein  38.92 
 
 
362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177157  normal  0.158984 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.22 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.7 
 
 
220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2929  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.61 
 
 
359 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  33.89 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  38.27 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
231 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  33.16 
 
 
228 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5847  OmpA/MotB:SmpA/OmlA  44.92 
 
 
292 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  33.76 
 
 
243 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  48.33 
 
 
278 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  43.85 
 
 
179 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  43.85 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  43.22 
 
 
830 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  43.85 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  43.85 
 
 
209 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  43.85 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  43.85 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  43.85 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  43.85 
 
 
224 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  44.78 
 
 
276 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  44.19 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  44.19 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  44.19 
 
 
222 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.19 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  44.19 
 
 
222 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  44.19 
 
 
222 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  44.19 
 
 
222 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  44.2 
 
 
357 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  44.2 
 
 
353 aa  96.3  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  44.2 
 
 
353 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2203  ompA family protein  43.8 
 
 
290 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.505527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2065  ompA family protein  43.8 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  40.68 
 
 
831 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  46.03 
 
 
358 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 
831 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  45.24 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  45.24 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  39.83 
 
 
831 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  45.24 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  45.24 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  44.53 
 
 
271 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  44.53 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 
831 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  44.53 
 
 
276 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  44.53 
 
 
276 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  44.53 
 
 
276 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  44.53 
 
 
276 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  45.24 
 
 
350 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  45.24 
 
 
354 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  45.24 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  44.53 
 
 
276 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  45.24 
 
 
365 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3148  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
371 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  43.09 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  44.8 
 
 
361 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1488  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  44.53 
 
 
298 aa  92.4  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.28 
 
 
215 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  44 
 
 
366 aa  92  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  42.28 
 
 
215 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  42.4 
 
 
355 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0237  OmpA/MotB domain protein  43.18 
 
 
491 aa  90.5  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3525  OmpA/MotB domain-containing protein  45.3 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  44.53 
 
 
232 aa  89.7  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  44 
 
 
354 aa  89.4  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  31.74 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  42.06 
 
 
358 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  42.06 
 
 
358 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  43.97 
 
 
376 aa  89  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  42.06 
 
 
371 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  42.06 
 
 
369 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  42.06 
 
 
369 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  42.86 
 
 
351 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  41.04 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  39.68 
 
 
830 aa  85.9  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  28.96 
 
 
266 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  41.1 
 
 
355 aa  85.5  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6244  OmpA/MotB domain-containing protein  39.17 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.768223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>