More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3118 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 242 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  68.18 
 
 		 214 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  67.47 
 
 		 218 aa  305  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  67.47 
 
 		 218 aa  305  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  65.86 
 
 		 219 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  64.46 
 
 		 210 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  66.11 
 
 		 212 aa  289  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  64.4 
 
 		 219 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  60.71 
 
 		 217 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  57.96 
 
 		 219 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  58.61 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  48.45 
 
 		 218 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  49.03 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  47.67 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  50.2 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  50.2 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  44.92 
 
 		 187 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.27 
 
 		 215 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  44.27 
 
 		 215 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  44.07 
 
 		 188 aa  191  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  41.67 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 222 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 222 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.18 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 222 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  42.34 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  42.34 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  42.34 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  42.34 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  42.34 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  41.44 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  62.88 
 
 		 607 aa  169  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  42.58 
 
 		 179 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  45.59 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  62.9 
 
 		 217 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  62.9 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  55.17 
 
 		 609 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  50 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  35.27 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 		 227 aa  118  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  50.83 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  50.94 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  40.12 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  50 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  50 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  50 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  50 
 
 		 344 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  49.22 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  49.02 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  50.78 
 
 		 350 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  50.78 
 
 		 350 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  44 
 
 		 387 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  44.87 
 
 		 344 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  41.27 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  46.08 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  44.23 
 
 		 344 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.94 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  50.94 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  52.73 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  42.54 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  42.54 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.58 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  46.55 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  43.31 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  41.09 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  42.74 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  41.09 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  40.62 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  48.44 
 
 		 351 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  45.76 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  47.71 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  48.18 
 
 		 376 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  47.57 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.31 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 		 537 aa  99.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  49.09 
 
 		 179 aa  99.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  51.49 
 
 		 420 aa  99.4  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  41.54 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 296 aa  99.4  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  43.97 
 
 		 669 aa  99.4  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  35.43 
 
 		 533 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  48.04 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  46.73 
 
 		 294 aa  99  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  42.02 
 
 		 355 aa  99  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  41.09 
 
 		 350 aa  99  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  41.09 
 
 		 346 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  41.09 
 
 		 346 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  41.09 
 
 		 358 aa  99  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  41.09 
 
 		 346 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  41.09 
 
 		 346 aa  98.6  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>