More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0995 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
179 aa  360  9e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  62.65 
 
 
178 aa  194  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  51.85 
 
 
362 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  50 
 
 
365 aa  104  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  48.18 
 
 
218 aa  97.8  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  48.18 
 
 
218 aa  97.8  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  49.09 
 
 
242 aa  97.1  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  44.14 
 
 
594 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  49.09 
 
 
219 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  44 
 
 
671 aa  95.5  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  46.36 
 
 
219 aa  94.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  35.03 
 
 
200 aa  94.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  48.15 
 
 
217 aa  94.4  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  45.53 
 
 
375 aa  92.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  46.36 
 
 
214 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  40 
 
 
430 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40 
 
 
350 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  43.4 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40 
 
 
350 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  45.45 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  46.9 
 
 
376 aa  88.6  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 
210 aa  88.2  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  38.58 
 
 
366 aa  86.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.53 
 
 
351 aa  85.9  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  42.73 
 
 
219 aa  85.5  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.7 
 
 
607 aa  85.9  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.69 
 
 
345 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  46.85 
 
 
236 aa  85.5  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 
210 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  42.62 
 
 
420 aa  84.3  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  38.46 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.92 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  42.34 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 
586 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  41.44 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.92 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  47.12 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  41.44 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  41.44 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  41.44 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  41.44 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  41.44 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  41.44 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.92 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 
233 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.15 
 
 
344 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 
217 aa  80.9  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  41.53 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  40 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  40 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  39.2 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 
375 aa  79  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  42.59 
 
 
375 aa  79.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.34 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.05 
 
 
230 aa  79  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.91 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  38.58 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  37.9 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  43.24 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  42.34 
 
 
218 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  38.18 
 
 
260 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  43.24 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  40.68 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  39.23 
 
 
237 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  39.23 
 
 
237 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 
322 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  38.74 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 
679 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  37.27 
 
 
260 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.39 
 
 
319 aa  77  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 
231 aa  77  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.5 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  35.86 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  37.27 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  32.1 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.48 
 
 
447 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 
1755 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  38.05 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  38.05 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  38.53 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  34.62 
 
 
344 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  35.14 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  38.39 
 
 
294 aa  75.1  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 
244 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>