More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4226 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
234 aa  473  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  55.93 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  51.44 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  48.12 
 
 
267 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  49.26 
 
 
242 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  41.7 
 
 
248 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.46 
 
 
220 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  42.13 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  39.41 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  44.19 
 
 
239 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  43.23 
 
 
220 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  42.79 
 
 
220 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  42.79 
 
 
220 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  41.4 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.23 
 
 
220 aa  138  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  41.78 
 
 
228 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  40.76 
 
 
221 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  40.76 
 
 
221 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  40.76 
 
 
221 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  41.71 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  48.11 
 
 
294 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  44.6 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  46.36 
 
 
217 aa  95.1  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.29 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  50.96 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  50.96 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  50.96 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  50.96 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  50.96 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  50.96 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  41.18 
 
 
330 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  50.96 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  45.53 
 
 
316 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  42.86 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  45.71 
 
 
334 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  41.96 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.56 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 
215 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
247 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  51.46 
 
 
215 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.91 
 
 
319 aa  89.4  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  41.96 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 
222 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  41.82 
 
 
237 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  41.82 
 
 
237 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  46.15 
 
 
222 aa  89  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  47.52 
 
 
243 aa  89  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  47.52 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
240 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 
207 aa  88.2  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  35.5 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
319 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.53 
 
 
321 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  33.5 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 
218 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  48.51 
 
 
226 aa  85.9  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 
221 aa  85.1  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  44.03 
 
 
464 aa  85.1  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  33.33 
 
 
195 aa  85.1  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  49.04 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  36.17 
 
 
367 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  47.66 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  43.59 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  42.52 
 
 
729 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  46.53 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 
242 aa  82  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  36.89 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  36.89 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  40.38 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  36.76 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  36.41 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  36.41 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  36.41 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  44.25 
 
 
216 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  44.25 
 
 
216 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  47.12 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  41.82 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 
214 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 
630 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  43.93 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  40.31 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  44.04 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>