More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0210 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  100 
 
 		 314 aa  648    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  46.22 
 
 		 319 aa  195  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  44.21 
 
 		 420 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  44.61 
 
 		 428 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.11 
 
 		 427 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.74 
 
 		 447 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.05 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  42.92 
 
 		 417 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.65 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  41.83 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  36.56 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  30.87 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.8 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  38.99 
 
 		 544 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 543 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.53 
 
 		 542 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.9 
 
 		 440 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  39.26 
 
 		 478 aa  113  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  45.07 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  34.98 
 
 		 456 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1987 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  42.96 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  36.16 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  35.43 
 
 		 380 aa  99.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  36.4 
 
 		 487 aa  99.4  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  39.86 
 
 		 376 aa  99  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  41.73 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.88 
 
 		 345 aa  96.7  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  38.85 
 
 		 209 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  46.36 
 
 		 1707 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  33.51 
 
 		 375 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  31.75 
 
 		 1755 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  37.91 
 
 		 445 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  32.2 
 
 		 727 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  33.71 
 
 		 449 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  32.96 
 
 		 637 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 		 374 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.58 
 
 		 240 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  33.14 
 
 		 440 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  42.75 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 445 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  32.4 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  35.86 
 
 		 350 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  35.86 
 
 		 350 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  30.54 
 
 		 458 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  40.71 
 
 		 669 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2655  agarase  40.71 
 
 		 1335 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0452542  normal  0.27666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  34.08 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  33.56 
 
 		 351 aa  89.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  34.9 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  34.9 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  34.9 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  34.23 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 		 230 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  34.27 
 
 		 502 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  35.1 
 
 		 231 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  34.23 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  50 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 		 191 aa  87  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 191 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 191 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  34.23 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.23 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  32.8 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  34 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2466  OmpA family protein  31.52 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.352028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  33.2 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  31.94 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  30.38 
 
 		 623 aa  82.8  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 		 537 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.67 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  33.33 
 
 		 196 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 		 196 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  36.23 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  40.71 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  36.99 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  36.49 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  31.31 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  45.71 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  31.03 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3170  OmpA/MotB domain-containing protein  27.13 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000129051  hitchhiker  0.0000476695 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.42 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3027  OmpA/MotB domain-containing protein  27.13 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3012  OmpA/MotB domain-containing protein  27.13 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000126863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1351  OmpA/MotB domain protein  27.13 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000530028  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  30.53 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  33.51 
 
 		 506 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  35.14 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  30.06 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 		 190 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  29.45 
 
 		 239 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  33.55 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  37.4 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>