More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2674 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  80.51 
 
 		 196 aa  332  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  79.47 
 
 		 191 aa  324  6e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  78.95 
 
 		 191 aa  322  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  78.42 
 
 		 191 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3012  OmpA/MotB domain-containing protein  75.63 
 
 		 196 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000126863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3027  OmpA/MotB domain-containing protein  75.63 
 
 		 196 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1351  OmpA/MotB domain protein  75.63 
 
 		 196 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000530028  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3170  OmpA/MotB domain-containing protein  75.63 
 
 		 196 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000129051  hitchhiker  0.0000476695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  45.36 
 
 		 189 aa  161  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  44.57 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  39.52 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  40.84 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1358  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000545475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  35.68 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2466  OmpA family protein  38.55 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.352028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.27 
 
 		 350 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.27 
 
 		 350 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.27 
 
 		 447 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  39.05 
 
 		 420 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 449 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.21 
 
 		 294 aa  98.6  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.04 
 
 		 351 aa  98.2  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  34.57 
 
 		 344 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  34.57 
 
 		 344 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.19 
 
 		 344 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  34.57 
 
 		 344 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  35.12 
 
 		 440 aa  95.5  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.54 
 
 		 240 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  33.95 
 
 		 345 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35.19 
 
 		 344 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  32.39 
 
 		 319 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  33.95 
 
 		 344 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  33.73 
 
 		 429 aa  92  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  30.98 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  32.53 
 
 		 368 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  31.29 
 
 		 367 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  33.14 
 
 		 401 aa  89  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  31.93 
 
 		 392 aa  89  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  34.32 
 
 		 239 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  36.09 
 
 		 244 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  34.94 
 
 		 239 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  34.94 
 
 		 394 aa  87  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  32.58 
 
 		 417 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  34.73 
 
 		 445 aa  86.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 363 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 		 428 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 403 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.09 
 
 		 542 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.18 
 
 		 427 aa  85.1  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.92 
 
 		 543 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 372 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 373 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  33.33 
 
 		 370 aa  85.1  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 369 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  35.33 
 
 		 237 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  33.73 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  33.95 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 544 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  31.68 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  31.9 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  32.73 
 
 		 314 aa  82  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  31.44 
 
 		 498 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  33.51 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  29.89 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  29.7 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 		 374 aa  79  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  31.98 
 
 		 637 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  32.12 
 
 		 369 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 454 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  32.12 
 
 		 369 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  38.68 
 
 		 260 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  29.52 
 
 		 377 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  32.62 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  31.48 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  31.52 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  35.16 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  38.68 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  30.72 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  31.98 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.13 
 
 		 623 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  32.39 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  29.01 
 
 		 365 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  32.5 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 296 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  41.73 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 317 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  29.01 
 
 		 367 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  28.92 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>