More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1151 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3012  OmpA/MotB domain-containing protein  41.05 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000126863  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  39.81 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1351  OmpA/MotB domain protein  41.05 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000530028  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3170  OmpA/MotB domain-containing protein  41.05 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000129051  hitchhiker  0.0000476695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3027  OmpA/MotB domain-containing protein  41.05 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232741  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  40.28 
 
 		 191 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  40.1 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  40.1 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  41.24 
 
 		 196 aa  131  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  34.1 
 
 		 190 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  37.32 
 
 		 198 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1358  OmpA/MotB  36.45 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000545475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  31.15 
 
 		 449 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  33.16 
 
 		 350 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  33.16 
 
 		 350 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  30.2 
 
 		 427 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  33.51 
 
 		 344 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  33.51 
 
 		 344 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  34.55 
 
 		 344 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.03 
 
 		 344 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  33.51 
 
 		 344 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  32.98 
 
 		 344 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2466  OmpA family protein  31.69 
 
 		 187 aa  86.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.352028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  32.98 
 
 		 345 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  30.89 
 
 		 351 aa  85.1  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  36.98 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  30.6 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  32.52 
 
 		 440 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  30.6 
 
 		 445 aa  81.6  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  30.85 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  31.18 
 
 		 428 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  35.98 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  30.22 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  32.43 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  30.94 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  28.02 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  29.67 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  31.32 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  39.25 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  43.43 
 
 		 1026 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3415  OmpA/MotB domain-containing protein  30.89 
 
 		 420 aa  75.1  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  30.22 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  31.38 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  30.65 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  46.05 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  30 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  30.05 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  32.8 
 
 		 543 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  28.73 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  46.23 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  31.38 
 
 		 394 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  31.87 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  27.62 
 
 		 367 aa  72  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  35.52 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  35.64 
 
 		 1987 aa  72  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.8 
 
 		 542 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 230 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  27.62 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  31.37 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  28.72 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  37.59 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  30.16 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  25.41 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08396  OmpA/MotB  32.79 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  32.8 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  29.44 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  30.35 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  28.84 
 
 		 478 aa  69.3  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  27.17 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  28.89 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  28.89 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  24.46 
 
 		 368 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  27.78 
 
 		 445 aa  68.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  30.69 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  27.17 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  34.03 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  41.12 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  26.67 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  36.02 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  43.37 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  29.51 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  44.32 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  28.26 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  38.46 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 333 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>