More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3415 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3415  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 420 aa  853    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08396  OmpA/MotB  46.53 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0864  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 		 376 aa  331  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1558  OmpA/MotB domain protein  43.04 
 
 		 397 aa  306  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0671389  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  28.15 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  33.85 
 
 		 319 aa  93.2  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.16 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  31.87 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  32.95 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.04 
 
 		 542 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  32.6 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  32.6 
 
 		 544 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  25.14 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  32.4 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  34.48 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  30.89 
 
 		 234 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  32.2 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  41.9 
 
 		 669 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  32.2 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  26.41 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  39.6 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  25.37 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  31.64 
 
 		 344 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.64 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  29.95 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.89 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  37.62 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  32 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  32.57 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  31.64 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  31.69 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  36.54 
 
 		 656 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  38.46 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  39.18 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  29.05 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  30.51 
 
 		 344 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  37.11 
 
 		 318 aa  67  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  29.94 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  29.94 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  30.86 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  28.83 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  28.76 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  29.38 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  28.41 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  34.58 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  30.11 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  28.88 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  29.28 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  37.08 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  25.3 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  28.33 
 
 		 196 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  28.41 
 
 		 191 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  29.89 
 
 		 260 aa  62  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 		 239 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.26 
 
 		 181 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  29.12 
 
 		 209 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  30.36 
 
 		 613 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  32.71 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 		 174 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  29.21 
 
 		 1755 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  34.29 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  33.66 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  23.52 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  37.08 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  30.41 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  25.38 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  33.33 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  34.65 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  33 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.53 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  29.03 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0749  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 		 169 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395754  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  27.84 
 
 		 337 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  31.73 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  34.62 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 487 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1710  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.24 
 
 		 158 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000475645  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  27.04 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.62 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  32.69 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  26.02 
 
 		 623 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3360  OmpA/MotB domain protein  29.15 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  30.48 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.09 
 
 		 671 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>