More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08396 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08396  OmpA/MotB  100 
 
 		 424 aa  863    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3415  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 		 420 aa  347  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1558  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 		 397 aa  292  9e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0671389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0864  OmpA/MotB domain-containing protein  37.59 
 
 		 376 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  31.49 
 
 		 319 aa  87.8  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  29.15 
 
 		 447 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  27.2 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  33.52 
 
 		 294 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  28.78 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.67 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  42.27 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  25.37 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  31.67 
 
 		 544 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  32.96 
 
 		 196 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  33.71 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  31.11 
 
 		 543 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  23.35 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  29.78 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  38.61 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  29.89 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  33.78 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  35.45 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  40.57 
 
 		 669 aa  70.1  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  27.78 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  31.28 
 
 		 196 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  28.89 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  28.41 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  29.02 
 
 		 623 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.14 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  29.21 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  39.58 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  28.09 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  29.05 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  25.66 
 
 		 656 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  29.19 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  34.48 
 
 		 296 aa  67  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  37.11 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  30.73 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  29.57 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  32.69 
 
 		 239 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  28.85 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 		 1026 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 		 613 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  32.88 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  30 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  28.33 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  35.05 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  35.92 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  36.78 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3170  OmpA/MotB domain-containing protein  33.52 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000129051  hitchhiker  0.0000476695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  32.19 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3012  OmpA/MotB domain-containing protein  33.52 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000126863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3027  OmpA/MotB domain-containing protein  33.52 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1351  OmpA/MotB domain protein  33.52 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000530028  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  32.19 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  31.62 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  31.65 
 
 		 229 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 		 240 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 		 262 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  26.4 
 
 		 237 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  32.12 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 240 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  26.84 
 
 		 631 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  34.72 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 230 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.11 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  40.66 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  38.37 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  26.79 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  38.37 
 
 		 261 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 230 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  38.37 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  38.37 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  38.37 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.14 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  38.37 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  34.02 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  37.78 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  38.37 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  38.37 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  36.78 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  29.55 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  26.15 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  28.88 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  35.63 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  36.19 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  38.37 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  34.19 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  35.63 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  30.94 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>