More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1558 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1558  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 397 aa  810    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0671389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3415  OmpA/MotB domain-containing protein  43.04 
 
 		 420 aa  306  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0864  OmpA/MotB domain-containing protein  39.55 
 
 		 376 aa  299  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08396  OmpA/MotB  39.61 
 
 		 424 aa  286  7e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  24.82 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  29.65 
 
 		 544 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  29.85 
 
 		 543 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.68 
 
 		 542 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  39.08 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  37.14 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  35 
 
 		 903 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  27.59 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  35.63 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  31.06 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  34.86 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  32.69 
 
 		 656 aa  67  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  36.46 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 671 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  34.17 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  31.41 
 
 		 637 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  33.04 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  33.04 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  25.41 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  35.96 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  32.18 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  40.82 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  36.19 
 
 		 669 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  30.25 
 
 		 613 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3921  OmpA/MotB  37.93 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  33.65 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  36.78 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  39.08 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  40.66 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  30.53 
 
 		 656 aa  63.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 		 174 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  40.62 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  31.3 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  36.67 
 
 		 271 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  34.74 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  32.99 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  33.65 
 
 		 509 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  34.85 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  32.18 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.36 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  36.67 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  36.54 
 
 		 694 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  31.87 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  31.16 
 
 		 712 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  34.35 
 
 		 641 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.08 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 1026 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  34.57 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  35.56 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  35.56 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  35.56 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  35.56 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.38 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  35.56 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  35.56 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2790  OmpA/MotB domain-containing protein  36.9 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  35.56 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  35.56 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  36.67 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  35.56 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  30.34 
 
 		 1313 aa  60.1  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  33.33 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  33.81 
 
 		 497 aa  59.7  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  40.22 
 
 		 457 aa  59.7  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.71 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  34.86 
 
 		 268 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  32.17 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  32.17 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  39.76 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  32.67 
 
 		 230 aa  59.7  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.71 
 
 		 226 aa  59.7  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  32.04 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  25.28 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.24 
 
 		 673 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  36.78 
 
 		 201 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>