More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1878 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  100 
 
 		 466 aa  941    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  43.69 
 
 		 214 aa  87.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 215 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  43.69 
 
 		 215 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 215 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 214 aa  86.7  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  42.72 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  42.72 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  42.72 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  42.72 
 
 		 261 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  42.72 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  42.72 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  42.72 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  44.33 
 
 		 214 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  42.2 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  42.72 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  40.78 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 232 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 729 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  40 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  38 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  45.98 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 219 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.86 
 
 		 240 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 244 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  37 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  40.2 
 
 		 217 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  44.68 
 
 		 1086 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  36.11 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 209 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  40.2 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.75 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  33.06 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  38.83 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  43.18 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  40.2 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  36.17 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  40.78 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  37.5 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  40.78 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  31.65 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  36.13 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  37.5 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  37.5 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  38.24 
 
 		 220 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 224 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  38.24 
 
 		 220 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  38.24 
 
 		 220 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  38 
 
 		 212 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  38.24 
 
 		 220 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  38.24 
 
 		 220 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  37.86 
 
 		 222 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 227 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  40.2 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  46 
 
 		 228 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 222 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  40.59 
 
 		 1793 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  37.86 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  40.59 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 200 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.86 
 
 		 212 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  31.71 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.28 
 
 		 630 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  40.78 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.6 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  39.81 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  46.32 
 
 		 1058 aa  73.6  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  38 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  27.37 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  39.81 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  40.78 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 230 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 219 aa  73.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  31.65 
 
 		 294 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>