More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1289 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
260 aa  520  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 
637 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  29.13 
 
 
440 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 
217 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 
217 aa  89  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.14 
 
 
217 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 
219 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  32.68 
 
 
1793 aa  86.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  42.45 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  28.65 
 
 
506 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 
216 aa  85.9  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  38.68 
 
 
225 aa  85.5  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 
216 aa  85.9  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  29.82 
 
 
208 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  38.68 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 
623 aa  83.2  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 
244 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 
209 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 
498 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  35.85 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  35.85 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  40.91 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  38.68 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  35.85 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  35.85 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  35.85 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  35.85 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  36.94 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  35.85 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  35.85 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  35.85 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  29.89 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
1755 aa  79.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  35.85 
 
 
316 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  37.74 
 
 
214 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 
218 aa  79  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  26.42 
 
 
540 aa  78.6  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  39.58 
 
 
656 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  28.81 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  34.91 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  36.45 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  36.45 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  37.14 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.33 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 
537 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  33.96 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  34.91 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  37.74 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
218 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2026  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  40.4 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2021  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  40.4 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  35.85 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.71 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  30.06 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0071  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  36.11 
 
 
192 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3694  OmpA/MotB  35.64 
 
 
188 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  39.39 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0072  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.11 
 
 
192 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.524746  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 
208 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  35.85 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  36.19 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  35.85 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  41.57 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  33.01 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  29.82 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0311  outer membrane protein, OmpA family  36.19 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  39.62 
 
 
669 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.4 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  26.29 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  42.7 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  39.39 
 
 
890 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  34.62 
 
 
903 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  43.82 
 
 
704 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  35.92 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 
537 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  36.7 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  37.25 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>