More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2081 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  360  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  48.55 
 
 
180 aa  156  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  47.7 
 
 
181 aa  153  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.4 
 
 
168 aa  154  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.71 
 
 
180 aa  150  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  45.71 
 
 
180 aa  150  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1012  OmpA domain-containing protein  44.69 
 
 
182 aa  147  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.91 
 
 
180 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  45.83 
 
 
179 aa  140  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.53 
 
 
172 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  40.8 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  40.8 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  40.8 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  40.8 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  40.8 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  40.8 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  40.8 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.08 
 
 
169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  39.66 
 
 
170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.51 
 
 
170 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  38.51 
 
 
170 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  38.51 
 
 
169 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  38.51 
 
 
170 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.51 
 
 
170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  40 
 
 
177 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1153  OmpA/MotB  41.52 
 
 
181 aa  124  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.08 
 
 
176 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.34 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.93 
 
 
169 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.93 
 
 
169 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.64 
 
 
187 aa  120  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2338  OmpA/MotB  40.46 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000002945  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.51 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 
163 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.66 
 
 
163 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  39.66 
 
 
163 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  52.38 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  41.85 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.56 
 
 
163 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0274  OmpA/MotB domain-containing protein  48.54 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00497769  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.21 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  50.48 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.11 
 
 
163 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 
163 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  48.54 
 
 
170 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.23 
 
 
170 aa  108  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  39.49 
 
 
165 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4052  OmpA/MotB  42.34 
 
 
180 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2205  outer membrane protein, porin-associated lipoprotein  36.61 
 
 
188 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.604308  hitchhiker  0.00226867 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.28 
 
 
172 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0302  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.84 
 
 
166 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.519391  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0784  OmpA/MotB domain-containing protein  34.3 
 
 
163 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0131111  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3831  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.08 
 
 
182 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.23 
 
 
167 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0781  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.82 
 
 
170 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1474  OmpA/MotB domain-containing protein  34.66 
 
 
163 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  42.28 
 
 
172 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  42.86 
 
 
169 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  49.51 
 
 
172 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0785  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.57 
 
 
174 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2563  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.27 
 
 
179 aa  103  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  38.86 
 
 
175 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0908  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.57 
 
 
174 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00670429  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.41 
 
 
199 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0812  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.57 
 
 
174 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.059882  normal  0.756228 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2713  OmpA/MotB  46.15 
 
 
175 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.202213  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0845  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.57 
 
 
174 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0876  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.57 
 
 
174 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0023901  normal  0.278188 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00701  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.26 
 
 
173 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000036029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.26 
 
 
173 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0770  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.26 
 
 
173 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0795  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.26 
 
 
173 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.12965e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0844  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.26 
 
 
173 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000018572  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0764  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.26 
 
 
173 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105937  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00690  hypothetical protein  35.26 
 
 
173 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000599147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2914  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.26 
 
 
173 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000121586  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0663  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.26 
 
 
173 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000160388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.26 
 
 
173 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  35.26 
 
 
193 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0562  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.27 
 
 
127 aa  100  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  43.14 
 
 
170 aa  100  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1528  OmpA domain-containing protein  31.84 
 
 
180 aa  101  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000113524  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.78 
 
 
163 aa  100  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  40.54 
 
 
194 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 
194 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  37.95 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1463  OmpA/MotB domain-containing protein  30.41 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000146392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0591  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.05 
 
 
241 aa  99  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2730  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.77 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000414349  hitchhiker  0.0000210242 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  46.08 
 
 
205 aa  98.6  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.69 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  38.41 
 
 
167 aa  97.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0100  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  42.86 
 
 
211 aa  97.8  7e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.949654  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  41.9 
 
 
135 aa  97.8  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.69 
 
 
173 aa  97.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1608  OmpA domain-containing protein  42.86 
 
 
178 aa  97.4  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000267608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0749  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.56 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395754  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2026  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  44.92 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1786  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.82 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000724127  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>