More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0024 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  100 
 
 
194 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  67.51 
 
 
193 aa  252  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  61.9 
 
 
194 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  51.26 
 
 
199 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.25 
 
 
199 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3499  OmpA/MotB  50.26 
 
 
194 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.87 
 
 
188 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.09 
 
 
200 aa  175  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.43 
 
 
185 aa  165  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  51.14 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.35 
 
 
187 aa  157  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0293  OmpA/MotB domain protein  44.9 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000135813  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.68 
 
 
176 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  44 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  44.39 
 
 
204 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  43.43 
 
 
167 aa  140  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.37 
 
 
170 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  64.15 
 
 
190 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0589  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.8 
 
 
179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0751  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.34 
 
 
153 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000145376  normal  0.0872971 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1911  OmpA domain-containing protein  43.03 
 
 
205 aa  132  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  55.66 
 
 
181 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0749  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.34 
 
 
169 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395754  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  53.27 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3633  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  54.72 
 
 
177 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113835  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  49.07 
 
 
174 aa  121  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.43 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.89 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0857  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.55 
 
 
155 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000523751  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1710  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.67 
 
 
158 aa  118  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000475645  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0225  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.77 
 
 
154 aa  117  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000120265  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  37.3 
 
 
170 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0752  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.95 
 
 
169 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000800754  normal  0.153168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.49 
 
 
175 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0615  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  50 
 
 
154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0124381  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0860  OmpA/MotB domain-containing protein  48.6 
 
 
152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.128552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0591  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.79 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0756  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.853822  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  51.85 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  35.98 
 
 
172 aa  111  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2159  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.66 
 
 
173 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109799  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  40.88 
 
 
173 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  33.52 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0437517  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.33 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0466  OmpA/MotB domain-containing protein  50.51 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0748  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.23 
 
 
153 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000605399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1528  OmpA domain-containing protein  52.53 
 
 
180 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000113524  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  40.25 
 
 
174 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.5 
 
 
166 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2563  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.52 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637753  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  50 
 
 
172 aa  108  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  45.37 
 
 
170 aa  107  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  49.02 
 
 
205 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2730  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.52 
 
 
178 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000414349  hitchhiker  0.0000210242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.71 
 
 
184 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.72 
 
 
163 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  47.06 
 
 
187 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2160  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.66 
 
 
157 aa  105  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000805861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.63 
 
 
180 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.02 
 
 
172 aa  105  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1397  OmpA/MotB  36.36 
 
 
176 aa  105  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1395  OmpA/MotB  50.49 
 
 
178 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000229219  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2085  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.52 
 
 
178 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000014342  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1210  peptidoglycan-associated lipoprotein  45 
 
 
158 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240268  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1858  OmpA domain-containing protein  49.49 
 
 
179 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000707454  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.53 
 
 
192 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.6 
 
 
163 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.61 
 
 
180 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  36.61 
 
 
180 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 
163 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  49.04 
 
 
189 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.57 
 
 
163 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  47.57 
 
 
163 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  44.74 
 
 
161 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  49.02 
 
 
177 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  48.48 
 
 
135 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  45.95 
 
 
166 aa  101  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  36.81 
 
 
181 aa  101  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1230  OmpA family protein  48.54 
 
 
215 aa  101  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.337438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3337  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.69 
 
 
242 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.477382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  42.52 
 
 
169 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  42.52 
 
 
168 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  43.56 
 
 
168 aa  101  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2747  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.51 
 
 
177 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  43.56 
 
 
168 aa  101  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0521  OmpA/MotB domain protein  43.36 
 
 
166 aa  101  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2530  OmpA/MotB domain-containing protein  50.51 
 
 
178 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000768197  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3831  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.49 
 
 
182 aa  101  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2367  OmpA/MotB domain-containing protein  50.51 
 
 
178 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000270429  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2439  OmpA/MotB domain-containing protein  50.51 
 
 
178 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  normal  0.228998 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.57 
 
 
168 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1463  OmpA/MotB domain-containing protein  47.57 
 
 
178 aa  101  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000146392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 
174 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3482  OmpA/MotB domain protein  36.09 
 
 
242 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.784899  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  36.76 
 
 
165 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.66 
 
 
163 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.52 
 
 
163 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  48.48 
 
 
168 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 
163 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2205  outer membrane protein, porin-associated lipoprotein  47.57 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.604308  hitchhiker  0.00226867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>