More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3831 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3831  peptidoglycan-associated lipoprotein  100 
 
 
182 aa  358  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1153  OmpA/MotB  51.69 
 
 
181 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4052  OmpA/MotB  46.11 
 
 
180 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2713  OmpA/MotB  43.96 
 
 
175 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.202213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  43.09 
 
 
170 aa  150  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2205  outer membrane protein, porin-associated lipoprotein  43.85 
 
 
188 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.604308  hitchhiker  0.00226867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.78 
 
 
170 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  42.54 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  42.54 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  42.54 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  42.54 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.22 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  42.22 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.09 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  42.54 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  42.22 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  42.54 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  42.54 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.44 
 
 
169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.44 
 
 
169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.33 
 
 
169 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  42.78 
 
 
169 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.99 
 
 
169 aa  144  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.18 
 
 
163 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  51.85 
 
 
175 aa  140  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0781  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.82 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  47.89 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.18 
 
 
163 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  47.18 
 
 
163 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  47.18 
 
 
163 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  59.8 
 
 
179 aa  137  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.27 
 
 
180 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.37 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.66 
 
 
163 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  43.66 
 
 
163 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2338  OmpA/MotB  38.2 
 
 
180 aa  132  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000002945  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  50.43 
 
 
169 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0302  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.94 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.519391  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  57.69 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  37.91 
 
 
177 aa  131  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.96 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  39.01 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  56.19 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  50 
 
 
173 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  50 
 
 
172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.96 
 
 
172 aa  128  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  36.46 
 
 
181 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  50 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.57 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  37.57 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  40.11 
 
 
174 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0274  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 
167 aa  124  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00497769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  41.44 
 
 
193 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1395  OmpA/MotB  34.62 
 
 
178 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000229219  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2228  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  37.7 
 
 
181 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  49.57 
 
 
184 aa  121  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  51.92 
 
 
179 aa  121  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1012  OmpA domain-containing protein  36.96 
 
 
182 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0950  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.22 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.660653  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1069  outer membrane protein P6 precursor  43.22 
 
 
178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.427526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.69 
 
 
170 aa  117  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3633  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  39.47 
 
 
177 aa  117  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.96 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.73 
 
 
192 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  37.1 
 
 
194 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1463  OmpA/MotB domain-containing protein  33.52 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000146392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1230  OmpA family protein  46.49 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.337438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1743  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.62 
 
 
178 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000604821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01565  outer membrane protein P6  35.92 
 
 
148 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1747  OmpA domain-containing protein  34.62 
 
 
178 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000284949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1786  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.62 
 
 
178 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000724127  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  34.07 
 
 
187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  51.43 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2563  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.26 
 
 
179 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2537  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.62 
 
 
178 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000399266  hitchhiker  0.000124284 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2367  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000270429  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2439  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  normal  0.228998 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2530  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000768197  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  37.02 
 
 
189 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.45 
 
 
185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3499  OmpA/MotB  37.1 
 
 
194 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1858  OmpA domain-containing protein  35.16 
 
 
179 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000707454  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2747  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.16 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1528  OmpA domain-containing protein  34.62 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000113524  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.41 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  37.79 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.05 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2730  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.16 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000414349  hitchhiker  0.0000210242 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  35.29 
 
 
173 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1608  OmpA domain-containing protein  32.97 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000267608  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0857  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.04 
 
 
155 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000523751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.04 
 
 
200 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0567  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.79 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22731  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  41.38 
 
 
174 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0784  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
163 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0131111  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  32.67 
 
 
205 aa  106  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  45.79 
 
 
135 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1474  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
163 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>