More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1012 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1012  OmpA domain-containing protein  100 
 
 
182 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  71.43 
 
 
181 aa  266  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  67.4 
 
 
180 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  67.4 
 
 
180 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  64.09 
 
 
180 aa  240  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  59.12 
 
 
172 aa  216  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  60.77 
 
 
177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  56.18 
 
 
180 aa  200  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  56.57 
 
 
179 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.49 
 
 
169 aa  164  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.25 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.65 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  46.37 
 
 
169 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.81 
 
 
169 aa  160  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.25 
 
 
169 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.25 
 
 
170 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  45.25 
 
 
170 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.25 
 
 
170 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  45.25 
 
 
170 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  48.48 
 
 
170 aa  158  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  51.52 
 
 
172 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  49.4 
 
 
179 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  45.95 
 
 
170 aa  156  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  47.88 
 
 
169 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  45.81 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  45.81 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  45.81 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  45.81 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  45.81 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  45.81 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  45.81 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.88 
 
 
173 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.37 
 
 
196 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.27 
 
 
173 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  44.69 
 
 
174 aa  147  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  40.88 
 
 
163 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  40.88 
 
 
163 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.88 
 
 
163 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.99 
 
 
167 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.35 
 
 
163 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2205  outer membrane protein, porin-associated lipoprotein  39.36 
 
 
188 aa  137  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.604308  hitchhiker  0.00226867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.13 
 
 
168 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1153  OmpA/MotB  42.54 
 
 
181 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.08 
 
 
163 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2338  OmpA/MotB  41.08 
 
 
180 aa  134  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000002945  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0274  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00497769  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  44.68 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0784  OmpA/MotB domain-containing protein  40.66 
 
 
163 aa  131  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0131111  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0302  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.59 
 
 
166 aa  131  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.519391  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.97 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4052  OmpA/MotB  45.45 
 
 
180 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2713  OmpA/MotB  38.67 
 
 
175 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.202213  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0781  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.15 
 
 
170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1474  OmpA/MotB domain-containing protein  38.17 
 
 
163 aa  122  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  39.01 
 
 
184 aa  121  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2228  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  39.11 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  53.92 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  38.25 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  39.11 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39.56 
 
 
173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  40.33 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00701  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.67 
 
 
173 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000036029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.67 
 
 
173 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2914  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.67 
 
 
173 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000121586  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0795  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.67 
 
 
173 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.12965e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.8 
 
 
168 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00690  hypothetical protein  38.67 
 
 
173 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000599147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0764  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.67 
 
 
173 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105937  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0844  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.67 
 
 
173 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000018572  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0770  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.67 
 
 
173 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0663  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.67 
 
 
173 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000160388  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0785  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.8 
 
 
174 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0876  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.8 
 
 
174 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0023901  normal  0.278188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0845  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.8 
 
 
174 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.25 
 
 
168 aa  115  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0908  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.8 
 
 
174 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00670429  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0812  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.8 
 
 
174 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.059882  normal  0.756228 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0562  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.64 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  37.23 
 
 
187 aa  111  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  46.53 
 
 
169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0567  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.74 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22731  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  46.53 
 
 
168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.96 
 
 
169 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.96 
 
 
169 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3831  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.61 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1398  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 
168 aa  108  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000375397  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2867  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 
168 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.859200000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2955  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.57 
 
 
168 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000883314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.94 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.22 
 
 
163 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.59 
 
 
192 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0100  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  43.27 
 
 
211 aa  104  7e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.949654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.61 
 
 
187 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1230  OmpA family protein  42.11 
 
 
215 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.337438  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.51 
 
 
165 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2026  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  35.39 
 
 
176 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2021  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  35.39 
 
 
176 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  50.5 
 
 
179 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.51 
 
 
166 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  48.51 
 
 
166 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>