More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2205 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2205  outer membrane protein, porin-associated lipoprotein  100 
 
 
188 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.604308  hitchhiker  0.00226867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.99 
 
 
176 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  45.9 
 
 
169 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.9 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.36 
 
 
170 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  45.36 
 
 
170 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  45.36 
 
 
170 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.36 
 
 
170 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0781  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.58 
 
 
170 aa  158  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2713  OmpA/MotB  45.79 
 
 
175 aa  155  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.202213  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  53.9 
 
 
170 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  57.85 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2338  OmpA/MotB  44.74 
 
 
180 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000002945  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  56.41 
 
 
169 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  51.85 
 
 
169 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  58.12 
 
 
169 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.85 
 
 
169 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  57.85 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  57.85 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  57.85 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  57.85 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  57.85 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  57.85 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  57.85 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0302  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.07 
 
 
166 aa  151  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.519391  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4052  OmpA/MotB  51.03 
 
 
180 aa  151  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  59.29 
 
 
172 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.32 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  43.32 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0274  OmpA/MotB domain-containing protein  56.03 
 
 
167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00497769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.47 
 
 
180 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  55.56 
 
 
173 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  56.64 
 
 
173 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  43.32 
 
 
181 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1474  OmpA/MotB domain-containing protein  43.09 
 
 
163 aa  142  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  42.33 
 
 
177 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0784  OmpA/MotB domain-containing protein  43.78 
 
 
163 aa  141  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0131111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1153  OmpA/MotB  55.46 
 
 
181 aa  141  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  43.46 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.82 
 
 
167 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3831  peptidoglycan-associated lipoprotein  57.02 
 
 
182 aa  137  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  52.99 
 
 
175 aa  137  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1012  OmpA domain-containing protein  39.36 
 
 
182 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  40.1 
 
 
187 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  52.54 
 
 
163 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.54 
 
 
163 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  52.54 
 
 
163 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.72 
 
 
172 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  58.33 
 
 
196 aa  131  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.46 
 
 
163 aa  131  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.28 
 
 
163 aa  131  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  43.16 
 
 
179 aa  131  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  50 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  50.43 
 
 
163 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 
184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  54.05 
 
 
179 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  41.76 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  50.89 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1230  OmpA family protein  48.25 
 
 
215 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.337438  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0567  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.93 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22731  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  50.44 
 
 
208 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.5 
 
 
172 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1069  outer membrane protein P6 precursor  49.54 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.427526  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0950  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.54 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.660653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2228  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  34.05 
 
 
181 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.1 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01565  outer membrane protein P6  45.87 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  36.96 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  37.3 
 
 
177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  48.31 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1528  OmpA domain-containing protein  35.71 
 
 
180 aa  110  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000113524  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.97 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2747  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.51 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1747  OmpA domain-containing protein  34.62 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000284949  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1743  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.62 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000604821  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2730  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.96 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000414349  hitchhiker  0.0000210242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2537  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.62 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000399266  hitchhiker  0.000124284 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1786  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.62 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000724127  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0562  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.67 
 
 
127 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2530  OmpA/MotB domain-containing protein  48.54 
 
 
178 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000768197  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2367  OmpA/MotB domain-containing protein  48.54 
 
 
178 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000270429  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2439  OmpA/MotB domain-containing protein  48.54 
 
 
178 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  normal  0.228998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.02 
 
 
192 aa  108  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1858  OmpA domain-containing protein  35.87 
 
 
179 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000707454  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 
174 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1608  OmpA domain-containing protein  46.6 
 
 
178 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000267608  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2563  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.97 
 
 
179 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637753  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.05 
 
 
199 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  47.62 
 
 
185 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1463  OmpA/MotB domain-containing protein  33.51 
 
 
178 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000146392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.9 
 
 
190 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  37.57 
 
 
187 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3118  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.95 
 
 
172 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.396871  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3694  OmpA/MotB  43.97 
 
 
188 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  36.41 
 
 
174 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  45.19 
 
 
135 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2085  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.48 
 
 
178 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000014342  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1395  OmpA/MotB  34.59 
 
 
178 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000229219  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  46.6 
 
 
172 aa  101  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0100  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  43.69 
 
 
211 aa  101  6e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.949654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>