More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3921 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3921  OmpA/MotB  100 
 
 
274 aa  560  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  38.77 
 
 
249 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1792  OmpA/MotB domain-containing protein  33.72 
 
 
251 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00059964  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  37.99 
 
 
240 aa  135  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  31.95 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  30.99 
 
 
245 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  32.97 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1876  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 
276 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190834  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2449  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 
276 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186851  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1828  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 
276 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.124445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1842  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2411  OmpA/MotB domain-containing protein  33.49 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00660043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  33.49 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  32.34 
 
 
278 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2194  OmpA family protein  37.74 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  35.92 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  32.08 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.97 
 
 
192 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  22.58 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  35.58 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  32.14 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  30.71 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  32.77 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  24.9 
 
 
222 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  32.14 
 
 
243 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  33.72 
 
 
374 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1558  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 
397 aa  63.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0671389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  36.47 
 
 
381 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.08 
 
 
170 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  29.31 
 
 
222 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  26.61 
 
 
510 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  25.68 
 
 
525 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0100  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  38.75 
 
 
211 aa  62.4  0.000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.949654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  35.92 
 
 
166 aa  62  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00701  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.56 
 
 
173 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000036029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.56 
 
 
173 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  33.33 
 
 
185 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2914  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.56 
 
 
173 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000121586  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0663  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.56 
 
 
173 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000160388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00690  hypothetical protein  30.56 
 
 
173 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000599147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0844  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.56 
 
 
173 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000018572  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 
331 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0764  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.56 
 
 
173 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105937  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0795  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.56 
 
 
173 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.12965e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0770  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.56 
 
 
173 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156204  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  30.71 
 
 
209 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  30.28 
 
 
429 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.65 
 
 
169 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  29.92 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.65 
 
 
169 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1280  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 
171 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000137851  hitchhiker  0.0000238774 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  31.39 
 
 
230 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  34.78 
 
 
135 aa  60.8  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  29.09 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  29.36 
 
 
223 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  30.71 
 
 
209 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1911  OmpA domain-containing protein  35 
 
 
205 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0785  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 
174 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639422  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.73 
 
 
172 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.95 
 
 
166 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  30.17 
 
 
322 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.48 
 
 
172 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0845  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 
174 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0812  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 
174 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.059882  normal  0.756228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0876  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 
174 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0023901  normal  0.278188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0908  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 
174 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00670429  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  26.27 
 
 
230 aa  60.1  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  29.7 
 
 
168 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  29.7 
 
 
168 aa  60.1  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  34.95 
 
 
166 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.95 
 
 
166 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.95 
 
 
179 aa  59.7  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  30.56 
 
 
218 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.51 
 
 
542 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.95 
 
 
165 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  29.66 
 
 
669 aa  59.7  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  29.75 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 
173 aa  59.3  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  33.33 
 
 
352 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2867  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35 
 
 
168 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.859200000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  33.63 
 
 
544 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2955  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35 
 
 
168 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000883314  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.02 
 
 
163 aa  58.9  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
208 aa  58.9  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003529  outer membrane protein  30.81 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.95 
 
 
166 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  34.95 
 
 
167 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02232  hypothetical protein  32.35 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  33.98 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  28.45 
 
 
223 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  40.79 
 
 
466 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  34.95 
 
 
165 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  28.85 
 
 
537 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.01 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  31.01 
 
 
217 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  31.01 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2205  outer membrane protein, porin-associated lipoprotein  34.31 
 
 
188 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.604308  hitchhiker  0.00226867 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  27.18 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  30.48 
 
 
217 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>