More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1911 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1911  OmpA domain-containing protein  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.5 
 
 
171 aa  191  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0749  peptidoglycan-associated lipoprotein  67.54 
 
 
169 aa  177  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395754  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2159  peptidoglycan-associated lipoprotein  66.38 
 
 
173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109799  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  54.26 
 
 
162 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0437517  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1710  peptidoglycan-associated lipoprotein  65.38 
 
 
158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000475645  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  43.06 
 
 
193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0751  peptidoglycan-associated lipoprotein  58.49 
 
 
153 aa  139  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000145376  normal  0.0872971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  41.71 
 
 
194 aa  138  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0860  OmpA/MotB domain-containing protein  58.1 
 
 
152 aa  137  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.128552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
194 aa  134  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0615  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  54.29 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0124381  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  39 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0225  peptidoglycan-associated lipoprotein  56.19 
 
 
154 aa  132  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000120265  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2160  peptidoglycan-associated lipoprotein  56.19 
 
 
157 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000805861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0752  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.21 
 
 
169 aa  129  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000800754  normal  0.153168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.36 
 
 
199 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  38.92 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3499  OmpA/MotB  38.58 
 
 
194 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0748  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.29 
 
 
153 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000605399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  52.38 
 
 
183 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  50.48 
 
 
180 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.6 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.71 
 
 
185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.62 
 
 
188 aa  118  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.92 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  50.48 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  50.48 
 
 
170 aa  114  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.81 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  46.23 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0591  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.23 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.48 
 
 
170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0756  OmpA/MotB domain-containing protein  49.04 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.853822  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  47.01 
 
 
204 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3633  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  53.33 
 
 
177 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.46 
 
 
176 aa  111  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0857  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.11 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000523751  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0466  OmpA/MotB domain-containing protein  50.94 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0589  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.49 
 
 
179 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.6 
 
 
166 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.74 
 
 
185 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  48.08 
 
 
170 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0293  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 
204 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000135813  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  46.67 
 
 
174 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  50 
 
 
175 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1210  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.51 
 
 
158 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240268  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.73 
 
 
177 aa  104  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.5 
 
 
190 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.6 
 
 
172 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  46.73 
 
 
168 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  46.73 
 
 
168 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.79 
 
 
168 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0783  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.73 
 
 
169 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0562  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.14 
 
 
127 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  49.02 
 
 
161 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  44.35 
 
 
172 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  46.53 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.56 
 
 
180 aa  97.8  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.66 
 
 
170 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3337  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.66 
 
 
242 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.477382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.54 
 
 
163 aa  97.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.66 
 
 
170 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  43.56 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.66 
 
 
170 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.87 
 
 
164 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  45.1 
 
 
172 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  48.51 
 
 
166 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.06 
 
 
163 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3482  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 
242 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.784899  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.02 
 
 
172 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  31.68 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  31.68 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  31.68 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  43.56 
 
 
165 aa  96.3  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  31.68 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  31.68 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  42.2 
 
 
181 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  31.68 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  31.68 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.12 
 
 
173 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3418  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 
242 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.56 
 
 
172 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.1 
 
 
169 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.54 
 
 
169 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0563  OmpA domain-containing protein  45.79 
 
 
182 aa  95.5  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570179  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.54 
 
 
169 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.12 
 
 
173 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  31 
 
 
174 aa  95.5  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  32.18 
 
 
170 aa  95.5  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1153  OmpA/MotB  45.19 
 
 
181 aa  95.1  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.63 
 
 
174 aa  95.1  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.1 
 
 
163 aa  94.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3185  OmpA/MotB domain-containing protein  32.99 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0671255  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.1 
 
 
163 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  45.1 
 
 
163 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 
163 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.52 
 
 
166 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  47.52 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.86 
 
 
172 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.12 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>