More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2493 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 245 aa  497  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  67.21 
 
 		 238 aa  347  8e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  64.08 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  61.18 
 
 		 255 aa  308  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1792  OmpA/MotB domain-containing protein  60.96 
 
 		 251 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00059964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  48.98 
 
 		 240 aa  236  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  46.8 
 
 		 264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2449  OmpA/MotB domain protein  55.98 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1828  OmpA/MotB domain-containing protein  55.98 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.124445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1876  OmpA/MotB domain-containing protein  55.98 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1842  OmpA/MotB domain-containing protein  55.43 
 
 		 276 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2411  OmpA/MotB domain-containing protein  51.09 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00660043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  51.09 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2194  OmpA family protein  44.97 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  33.72 
 
 		 278 aa  134  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  32.77 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3921  OmpA/MotB  31.69 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  32.41 
 
 		 670 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  32.41 
 
 		 1313 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  37.14 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003529  outer membrane protein  31.68 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  30.46 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  33.94 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  33.94 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 490 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  32.73 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  30.91 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  30.91 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  33.02 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02232  hypothetical protein  33.62 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 1026 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  30.91 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  34.34 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 		 658 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  26.98 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  29.09 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 498 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  44.79 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  32.73 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  28.57 
 
 		 424 aa  65.9  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 398 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  33.64 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 704 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  29.08 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.08 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  31.45 
 
 		 673 aa  65.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  32.82 
 
 		 427 aa  65.1  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  33.01 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  32.32 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  34.62 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  24.86 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  27.62 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  30.77 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  32.69 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  30.1 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  35.05 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  31.07 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  28.21 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30.48 
 
 		 641 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  32.99 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  30 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  31.82 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  25.12 
 
 		 537 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  32.46 
 
 		 903 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  30.91 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.09 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  31.85 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  31.78 
 
 		 640 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  34.88 
 
 		 672 aa  62.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 		 586 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  30.1 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  29.81 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  33.04 
 
 		 420 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 236 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  33.33 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  30.1 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  28.68 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  28.68 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  34.58 
 
 		 175 aa  62  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  28.68 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  29.46 
 
 		 296 aa  62  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  28.68 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  28.68 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  31.19 
 
 		 217 aa  62  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  28.68 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  26.79 
 
 		 218 aa  62  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  32.32 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>