More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2517 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  64.08 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  62.45 
 
 		 238 aa  315  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  58.43 
 
 		 255 aa  295  7e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1792  OmpA/MotB domain-containing protein  55.38 
 
 		 251 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00059964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  53.28 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1828  OmpA/MotB domain-containing protein  59.18 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.124445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2449  OmpA/MotB domain protein  59.18 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1876  OmpA/MotB domain-containing protein  58.67 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1842  OmpA/MotB domain-containing protein  59.18 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  46.97 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2411  OmpA/MotB domain-containing protein  51.02 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00660043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  51.02 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  39.43 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2194  OmpA family protein  41.67 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3921  OmpA/MotB  38.77 
 
 		 274 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  35.04 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  30.48 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003529  outer membrane protein  37.5 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  26.84 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  25.73 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  34.95 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  33.65 
 
 		 209 aa  72  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 224 aa  72  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  37 
 
 		 241 aa  72  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  24.87 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02232  hypothetical protein  32.76 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  31.11 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  32.03 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  35.58 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  29.37 
 
 		 1313 aa  69.3  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  34.62 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  34.62 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  34.62 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  34.62 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  34.62 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  34.62 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 412 aa  68.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  25.57 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  30.48 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  30.37 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  35.64 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  33.33 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  32.71 
 
 		 466 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  28.91 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  28.91 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  32.71 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.43 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  31.73 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  34.62 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 543 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  34.62 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  30 
 
 		 542 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  30.47 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  25.69 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  31.53 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  25.86 
 
 		 182 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  31.53 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  29.73 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  29.91 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  27.57 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  26.39 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  22.1 
 
 		 890 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  25.32 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  25.32 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  25.97 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  25.32 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  36.63 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  29.81 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  25.32 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  25.32 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  25.32 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  27.91 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  29.81 
 
 		 525 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  25.59 
 
 		 704 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  27.91 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  33.01 
 
 		 490 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  29.9 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  27.91 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  34.78 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  24.64 
 
 		 464 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  27.62 
 
 		 463 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  28.81 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  28.18 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>