More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2194 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2194  OmpA family protein  100 
 
 		 269 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  79.55 
 
 		 264 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2411  OmpA/MotB domain-containing protein  79.55 
 
 		 264 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00660043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  79.55 
 
 		 264 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1876  OmpA/MotB domain-containing protein  60 
 
 		 276 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1842  OmpA/MotB domain-containing protein  60 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1828  OmpA/MotB domain-containing protein  59.64 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.124445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2449  OmpA/MotB domain protein  58.93 
 
 		 276 aa  254  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  41.04 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  41.47 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  42.05 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  44.09 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1792  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 251 aa  169  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00059964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  38.82 
 
 		 238 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  32.75 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  31.38 
 
 		 230 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3921  OmpA/MotB  37.39 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  30.43 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  29.41 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  30.43 
 
 		 464 aa  65.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  28.95 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  28.95 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  29.57 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  33.04 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  30.43 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  28.7 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  29.73 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  29.57 
 
 		 463 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  30.09 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  26.95 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  31.37 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  33.64 
 
 		 212 aa  62  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  29.03 
 
 		 537 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  27.83 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  27.68 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  33.33 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  26.02 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  27.93 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  25.26 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  27.88 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 1026 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  32.18 
 
 		 704 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  27.83 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.16 
 
 		 707 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  28.43 
 
 		 670 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  29.06 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  28.7 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  30.7 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  31.97 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  28.7 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  27.83 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  33.98 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  26.79 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  29.57 
 
 		 463 aa  58.9  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  29.89 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  26.79 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  26.79 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  30.19 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  30.91 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  29.25 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  27.83 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  28.83 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  28.74 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  33.02 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  33.33 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  25.62 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  31.37 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  26.45 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  31.36 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  30 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  31.73 
 
 		 631 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  29.2 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  28.74 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  31 
 
 		 1313 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  32.08 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  26.6 
 
 		 517 aa  56.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  30.48 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  29.81 
 
 		 525 aa  55.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  33.02 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  26.96 
 
 		 464 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  27.27 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  32.48 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>