More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1792 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1792  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00059964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  60.96 
 
 		 245 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  55.38 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  56.57 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  47.67 
 
 		 255 aa  241  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  52.61 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  43.35 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2449  OmpA/MotB domain protein  51.83 
 
 		 276 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1828  OmpA/MotB domain-containing protein  51.83 
 
 		 276 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.124445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1876  OmpA/MotB domain-containing protein  52.07 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1842  OmpA/MotB domain-containing protein  51.61 
 
 		 276 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2411  OmpA/MotB domain-containing protein  47.67 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00660043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  47.67 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  35.83 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2194  OmpA family protein  41.97 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3921  OmpA/MotB  33.59 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  32.68 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  39.05 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  32.09 
 
 		 670 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  35.09 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  31.61 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  34.68 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  37.84 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  37.84 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  34.29 
 
 		 1313 aa  75.5  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  35.48 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  35.48 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  34.06 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  34.71 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  35.35 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  30.94 
 
 		 182 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  35.04 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  34.06 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  34.06 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  34.06 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  34.06 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  34.78 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  34.06 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  34.06 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.11 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  32.64 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  33.98 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 543 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  34.06 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.54 
 
 		 542 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  26.07 
 
 		 704 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  25.3 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 229 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 221 aa  72  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  36.19 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 456 aa  72  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  34.29 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  32.5 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  36.19 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  27.62 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  30.22 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  34.06 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.83 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  30.22 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  24.24 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  35.24 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  29.25 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  27.23 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  31.11 
 
 		 694 aa  69.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  29.93 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  35.19 
 
 		 466 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  33.33 
 
 		 620 aa  69.3  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  26.54 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  31.48 
 
 		 457 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.61 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  32.61 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  30.83 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  26.09 
 
 		 641 aa  68.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  32.41 
 
 		 466 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  30.83 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  30.83 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  30.63 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  24 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  32.04 
 
 		 890 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  30.83 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  32.33 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  30.84 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  39.13 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  28.24 
 
 		 640 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>